MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3059 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-3059 Cfa-Mir-3059 Cpo-Mir-3059 Dno-Mir-3059 Ete-Mir-3059 Hsa-Mir-3059 Mml-Mir-3059 Ocu-Mir-3059 Rno-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr10: 101772704-101772761 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUACACAGGUGUAUCACAGGUGGUACGCCCUUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGUAGCUCUAACUACCCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGGGUGAACAGCCUUACUAUUUCUACAACUCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUACACAGGUGUAUCAC--| G A UUU - G CAU UAGC AGGU GU CGCCC CCU CUCU CCC AGGGUG U UCCG CA GUGGG GGA GAGA GGG UCCCAU C GACUCAACAUCUUUAUCAU^ A A UU- A A AUC CAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-3059_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGU -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3059-5p miRDB: MIMAT0014811 |
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Star sequence | Mmu-Mir-3059_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0014812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGG -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3059-3p miRDB: MIMAT0014812 |