| MirGeneDB ID | Mml-Mir-7181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7181 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAGCCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-7181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr20: 41035061-41035121 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7181) |
Mir-138-P2
chr20: 41030006-41030073 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7181 chr20: 41035061-41035121 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAGGGUCCUCUCUGACAGCUGUUCCUUCUUGGGUCCUGGCUGGAGAUCUCUGCUGCCCCCAGACUCAGAGGAGCCACUCCAGGACUCAGGGAGUGGCUGGCUUUGGGCCAGCCCAGCCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCAGGGUCCUCUCUGAC- - UC C-| AGA GCUGCCC AGCU GU CUUCUUGGGUCCUGG UGG UCUCU \ UCGG CG GAGGGACUCAGGACC ACC GGAGA C UCCCGACCCGACCGGGUU U GU UC^ GA- CUCAGAC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-7181_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGGUCCUGGCUGGAGAUCUCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-7181-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-7181_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AGGAGCCACUCCAGGACUCAGG -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-7181-3p |
