MirGeneDB ID | Hsa-Mir-95-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUCAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-95-P1 Hsa-Mir-95-P2 Hsa-Mir-95-P3-v2 Hsa-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95-P3-v1 Bta-Mir-95-P3-v2 Cfa-Mir-95-P3-v1 Cfa-Mir-95-P3-v2 Cpo-Mir-95-P3 Dno-Mir-95-P3-v1 Dno-Mir-95-P3-v2 Mml-Mir-95-P3-v1 Mml-Mir-95-P3-v2 Ocu-Mir-95-P3-v1 Ocu-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 74287125-74287187 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-95-P3-v1) |
Mir-95-P3-v1
chrX: 74287125-74287187 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-95-P3-v2 chrX: 74287126-74287185 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 chrX: 74287295-74287346 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUCAGUAAAUGUUUAUUAGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAGCAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAGCUCCACAGGCUCUGGAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCCAGAGCCCAGCCUGG-- A CU-| A A AAUAAAU CAC UUAGUAGGC CAGUAAAUGUUU UU GAUG \ GUG AAUCGUCCG GUUAUUUACAAA GA CUAC G UUAGGUCUCGGACACCUCGA A UGU^ C - UCAGUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-95-P3-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAGUAAAUGUUUAUUAGAUG -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004785 TargetScanVert: hsa-miR-545-5p TargetMiner: hsa-miR-545-5p miRDB: MIMAT0004785 |
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Star sequence | Hsa-Mir-95-P3-v1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0003165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UCAGCAAACAUUUAUUGUGUGCC -63
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003165 TargetScanVert: hsa-miR-545-3p TargetMiner: hsa-miR-545-3p miRDB: MIMAT0003165 |