MirGeneDB ID | Mml-Mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-493 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGUACAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-493 Cfa-Mir-493 Cpo-Mir-493 Dno-Mir-493 Ete-Mir-493 Hsa-Mir-493 Mmu-Mir-493 Ocu-Mir-493 Rno-Mir-493 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr7: 163202852-163202913 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-493) |
Mir-770
chr7: 163185011-163185072 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr7: 163202852-163202913 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr7: 163215224-163215287 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr7: 163216095-163216168 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr7: 163217199-163217254 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr7: 163218697-163218765 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr7: 163245322-163245378 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUUCGGGGCUCAUUCUGGCCUCCAGGGCUUUGUACAUGGUAGGCUUUCAUUCAUUCGUUUGCACAUUCGGUGAAGGUCUACUGUGUGCCAGGCCCUGUGCCAGGCAUCGUGUAGAUGGACGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUUCGGGGCUCAUUCU---| CUC U CAUUCGUU GGC CAGGGCUU GUACAUGGUAGGCUUUCAUU \ CCG GUCCCGGA CGUGUGUCAUCUGGAAGUGG U GCAGGUAGAUGUGCUACGGA^ U-- C CUUACACG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-493_5p |
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mirBase accession | MIMAT0026884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-493-5p |
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Co-mature sequence | Mml-Mir-493_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- UGAAGGUCUACUGUGUGCCAG -62
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-493-3p |