reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

References
Tissue	Paper	Accesion
brain	Warnefors et al. 2014	SRR1231993
heart	Warnefors et al. 2014	SRR1231994

Xla-Mir-23-P4d

Relative expression

Relative expression

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 154.12/2.96 = 52.0

Global results

ratio mature/star: 154.12/2.96 = 52.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 582.87/0.0 = None

mature (isoform content): 79.09% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Show details:

stage_34-36_SRR2147030

ratio mature/star: 156.0/3.0 = 52.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 590.0/0.0 = None

mature (isoform content): 79.09% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

stage_34-36_SRR2147030

ratio mature/star: 156.0/3.0 = 52.0

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		93	91.88	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		53	52.36	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		10	9.88	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	U	C	C	U	G	G	C	A	G	A	G	U	G	A	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	2.96	Xla-Mir-23-P4c
G	U	G	A	G	U	C	U	U	U	U	U	U	U	C	A	C	C	C	U	G	C	A	G	C	U	G	G	U	A	G	G	A	U	U	C	C	U	G	G	C	A	G	A	G	U	G	A	U	U	U	G	G	A	U	A	U	G	U	A	U	G	G	U	A	C	A	A	A	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	A	U	C	A	G	U	C	A	C	A	G	U	C	C	A	A	U	C	G	U	U	C	U	C	C	U	U	U	U	C

download reads

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		93	91.88	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		53	52.36	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		10	9.88	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	U	C	C	U	G	G	C	A	G	A	G	U	G	A	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	2.96	Xla-Mir-23-P4c
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		6	5.93	Xla-Mir-23-P3c, Xla-Mir-23-P3d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		12	11.86	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.99	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	A	C	C	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		64	63.23	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	A	C	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		404	399.12	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	A	C	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		61	60.26	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	A	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		22	21.73	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	A	C	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		14	13.83	Xla-Mir-23-P2c, Xla-Mir-23-P2d, ...
G	U	G	A	G	U	C	U	U	U	U	U	U	U	C	A	C	C	C	U	G	C	A	G	C	U	G	G	U	A	G	G	A	U	U	C	C	U	G	G	C	A	G	A	G	U	G	A	U	U	U	G	G	A	U	A	U	G	U	A	U	G	G	U	A	C	A	A	A	A	U	C	A	C	A	U	U	G	C	C	A	G	G	G	A	U	U	U	C	C	A	A	U	C	A	G	U	C	A	C	A	G	U	C	C	A	A	U	C	G	U	U	C	U	C	C	U	U	U	U	C

download reads

download reads