Xla-Mir-144-P1-v2

reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

Xla-Mir-144-P1-v2

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads ▾	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	28	299.08	Xla-Mir-144-P1-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8	85.45	Xla-Mir-144-P1-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	4	42.73	Xla-Mir-144-P1-v1
C	U	G	U	A	C	U	U	G	A	G	G	C	C	U	U	U	G	G	G	A	C	U	G	A	G	U	U	U	G	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	A	A	G	U	U	U	G	U	U	U	U	A	A	G	A	C	A	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	G	C	C	G	U	C	G	C	U

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	4	42.73	Xla-Mir-144-P1-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	28	299.08	Xla-Mir-144-P1-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8	85.45	Xla-Mir-144-P1-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	32.04	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	32.04	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	7	74.77	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	42.73	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	21.36	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	21.36	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	U	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	7	74.77	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	21.36	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8	85.45	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	G	A	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	A	A	G	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	138.86	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	A	A	G	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	A	A	G	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	A	U	A	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	21.36	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	10.68	Xla-Mir-144-P1-v1, Xla-Mir-144-P2-v1, ...
C	U	G	U	A	C	U	U	G	A	G	G	C	C	U	U	U	G	G	G	A	C	U	G	A	G	U	U	U	G	G	G	A	U	A	U	C	A	U	C	A	U	A	U	A	C	U	G	U	A	A	G	U	U	U	G	U	U	U	U	A	A	G	A	C	A	C	U	A	C	A	G	U	A	U	A	G	A	U	G	A	U	G	U	A	C	U	A	C	A	C	C	A	A	G	U	C	U	C	U	C	A	A	G	C	A	C	C	C	G	C	C	G	U	C	G	C	U

download reads

References
Tissue	Paper	Accesion
egg_xla_SRR2147026	SRR2147026	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26506012/
embryo-stage-7-8_xla_SRR2147027	SRR2147027	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26506012/
embryo-stage-12_xla_SRR2147028	SRR2147028	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26506012/
stage-34-36_xla_SRR2147030	SRR2147030	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26506012/
stage-56_xla_SRR2147031	SRR2147031	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26506012/
kidney_xla_SRR5753209	SRR5753209	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30375416/
heart_xla_SRR9989206	SRR9989206	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33663371/