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Tni-Mir-29-P1d2

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 615.62/569.28 = 1.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 69.55/6.12 = 11.36

mature (isoform content): 10.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 1.06% (homogeneous)

spleen-treatment1_tni_SRR1183459

ratio mature/star: 1407.0/58.0 = 24.26
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 139.0/18.0 = 7.72

mature (isoform content): 8.99% (homogeneous)
star (isoform content): 23.68% (heterogeneous)

total-animal_tni

ratio mature/star: 11.0/52.0 = 0.21
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/0.0 = None

mature (isoform content): 15.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

spleen-control_tni_SRR1183424

ratio mature/star: 1707.0/48.0 = 35.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 165.0/22.0 = 7.5

mature (isoform content): 8.81% (homogeneous)
star (isoform content): 31.43% (heterogeneous)

spleen-treatment2_tni_SRR1183464

ratio mature/star: 1526.0/31.0 = 49.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 145.0/17.0 = 8.53

mature (isoform content): 8.68% (homogeneous)
star (isoform content): 35.42% (heterogeneous)

spleen-treatment1_tni_SRR1183459

ratio mature/star: 1407.0/58.0 = 24.26

total-animal_tni

ratio mature/star: 11.0/52.0 = 0.21

spleen-control_tni_SRR1183424

ratio mature/star: 1707.0/48.0 = 35.56

spleen-treatment2_tni_SRR1183464

ratio mature/star: 1526.0/31.0 = 49.23

Reads

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References
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total-animal_tni	NA	NA