Sha-Mir-7373-o8j

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bone-marrow_sha_SRR034108

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testis_sha_SRR034116

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skin_sha_SRR034110

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brain_sha_SRR034105

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Tissue	Paper	Accesion
kidney_sha_SRR034104	SRR034104	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
brain_sha_SRR034105	SRR034105	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
heart_sha_SRR034106	SRR034106	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
liver_sha_SRR034107	SRR034107	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
bone-marrow_sha_SRR034108	SRR034108	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
pancreas_sha_SRR034109	SRR034109	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
skin_sha_SRR034110	SRR034110	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
spleen_sha_SRR034111	SRR034111	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
testis_sha_SRR034116	SRR034116	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575
lymphnode_sha_SRR034117	SRR034117	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20044575