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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

bone-marrow_sha_SRR034108

ratio mature/star: 434.0/71.0 = 6.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 206.0/4.0 = 51.5

mature (isoform content): 32.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.33% (homogeneous)

heart_sha_SRR034106

ratio mature/star: 206.0/27.0 = 7.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 98.0/2.0 = 49.0

mature (isoform content): 32.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.9% (homogeneous)

kidney_sha_SRR034104

ratio mature/star: 1044.0/84.0 = 12.43
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 463.0/3.0 = 154.33

mature (isoform content): 30.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.45% (homogeneous)

testis_sha_SRR034116

ratio mature/star: 258.0/29.0 = 8.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 77.0/0.0 = None

mature (isoform content): 22.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

skin_sha_SRR034110

ratio mature/star: 379.0/9.0 = 42.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 190.0/2.0 = 95.0

mature (isoform content): 33.39% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.18% (heterogeneous)

liver_sha_SRR034107

ratio mature/star: 471.0/23.0 = 20.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 225.0/2.0 = 112.5

mature (isoform content): 32.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.0% (homogeneous)

brain_sha_SRR034105

ratio mature/star: 59.0/9.0 = 6.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35.0/4.0 = 8.75

mature (isoform content): 37.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.77% (heterogeneous)

lymphnode_sha_SRR034117

ratio mature/star: 436.0/32.0 = 13.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 216.0/2.0 = 108.0

mature (isoform content): 33.13% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.88% (homogeneous)

spleen_sha_SRR034111

ratio mature/star: 2719.0/215.0 = 12.65
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 623.0/12.0 = 51.92

mature (isoform content): 18.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.29% (homogeneous)

pancreas_sha_SRR034109

ratio mature/star: 104.0/10.0 = 10.4
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 32.0/0.0 = None

mature (isoform content): 23.53% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

bone-marrow_sha_SRR034108

ratio mature/star: 434.0/71.0 = 6.11

heart_sha_SRR034106

ratio mature/star: 206.0/27.0 = 7.63

kidney_sha_SRR034104

ratio mature/star: 1044.0/84.0 = 12.43

testis_sha_SRR034116

ratio mature/star: 258.0/29.0 = 8.9

skin_sha_SRR034110

ratio mature/star: 379.0/9.0 = 42.11

liver_sha_SRR034107

ratio mature/star: 471.0/23.0 = 20.48

brain_sha_SRR034105

ratio mature/star: 59.0/9.0 = 6.56

lymphnode_sha_SRR034117

ratio mature/star: 436.0/32.0 = 13.63

spleen_sha_SRR034111

ratio mature/star: 2719.0/215.0 = 12.65

pancreas_sha_SRR034109

ratio mature/star: 104.0/10.0 = 10.4

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.88
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	64	109.14
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	2.36
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	G	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	7.27
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	G	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	45	129.55
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	G	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.88
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	C	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	58	99.31
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	C	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	7.98
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	5.51
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	U	A	C	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.88
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	A	A	G	U	G	C	U	G	U	U	C	G	U	G	C	A	G	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.88
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