Rno-Mir-542-P1a

reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

References
Tissue	Paper	Accesion
DRG-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
adrenal-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
biceps-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
biceps-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
biceps-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
biceps-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
brainstem-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
brainstem-male-homogenized5in1_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
brainstem-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cerebellum-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cerebellum-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
DRG-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cerebrum-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cortex-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cortex-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cortex-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cortex-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
duodenum-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
medulla-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
duodenum-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
duodenum-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
kidney-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
heart-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
heart-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
cerebrum-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
hippocampus-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
hippocampus-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
ileum-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
ileum-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
jejunum-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
jejunum-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
kidney-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
kidney-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
kidney-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
ovary-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
pancreas-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
pancreas-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
liver-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
liver-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
liver-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
liver-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
soleus-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
soleus-male-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
soleus-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
medulla-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
duodenum-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
stomach-glandular-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
stomach-non-glandular-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
uterus-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
testes-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
whole-blood-male_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
stomach-glandular-female_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
soleus-female-homogenized_rno_PRJNA312384	PRJNA312384	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27576563/
brain_rno_SRR2143325	SRR2143325	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
fat-subcutanous_rno_SRR2143326	SRR2143326	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
heart_rno_SRR2143327	SRR2143327	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
kidney_rno_SRR2143328	SRR2143328	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
large-intestine_rno_SRR2143329	SRR2143329	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
liver2_rno_SRR2143330	SRR2143330	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
lung_rno_SRR2143331	SRR2143331	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
muscle_rno_SRR2143332	SRR2143332	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
pancreas_rno_SRR2143333	SRR2143333	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
skin_rno_SRR2143337	SRR2143337	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
small-intestine_rno_SRR2143338	SRR2143338	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
spleen_rno_SRR2143339	SRR2143339	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
stomach_rno_SRR2143340	SRR2143340	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
testes_rno_SRR2143341	SRR2143341	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
thymus_rno_SRR2143342	SRR2143342	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
liver1_rno_SRR768350	SRR768350	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24472605

Rno-Mir-542-P1a

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads ▾	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	28	12.63	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	17	7.67	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	14	6.32	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	5.86	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	12	5.41	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	10	4.51	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	1.8	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	1.35	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	1.35	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.9	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	G	C	A	A	G	G	A	U	C	U	C	A	G	A	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
U	G	A	A	G	U	U	C	C	A	C	A	U	G	C	A	A	G	G	A	U	C	U	C	A	G	A	C	G	U	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	G	A	U	A	C	C	A	C	U	G	C	G	C	A	C	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	G	U	C	U	G	G	G	A	G	C	C	A	C	U	C	C	U	C	U	U	C	C	U	A	A	G	A	A	U	A

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	17	7.67	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	28	12.63	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	1.8	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	12	5.41	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	1.35	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.9	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	1.35	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	10	4.51	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	14	6.32	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	5.86	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	U	G	C	A	A	G	G	A	U	C	U	C	A	G	A	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5	2.26	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.9	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.9	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	55	24.81	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.45	Rno-Mir-542-P1c, Rno-Mir-542-P1b
U	G	A	A	G	U	U	C	C	A	C	A	U	G	C	A	A	G	G	A	U	C	U	C	A	G	A	C	G	U	C	U	C	G	G	G	G	A	U	C	A	U	C	A	U	G	U	C	A	C	G	A	G	A	U	A	C	C	A	C	U	G	C	G	C	A	C	U	U	G	U	G	A	C	A	G	A	U	U	G	A	U	A	A	C	U	G	A	A	A	G	G	U	C	U	G	G	G	A	G	C	C	A	C	U	C	C	U	C	U	U	C	C	U	A	A	G	A	A	U	A

download reads

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch