Rno-Mir-3068

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brain_rno_SRR2143325	SRR2143325	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
fat-subcutanous_rno_SRR2143326	SRR2143326	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
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lung_rno_SRR2143331	SRR2143331	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
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pancreas_rno_SRR2143333	SRR2143333	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
skin_rno_SRR2143337	SRR2143337	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
small-intestine_rno_SRR2143338	SRR2143338	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
spleen_rno_SRR2143339	SRR2143339	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
stomach_rno_SRR2143340	SRR2143340	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
testes_rno_SRR2143341	SRR2143341	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
thymus_rno_SRR2143342	SRR2143342	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
liver1_rno_SRR768350	SRR768350	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24472605

Rno-Mir-3068

kidney-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2168.0/49.0 = 44.24
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 178.0/5.0 = 35.6

co-mature (isoform content): 7.59% (homogeneous)
mature (isoform content): 9.26% (homogeneous)

liver-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 160.0/1.0 = 160.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 23.0/1.0 = 23.0

co-mature (isoform content): 12.57% (heterogeneous)
mature (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

biceps-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1802.0/50.0 = 36.04
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 202.0/7.0 = 28.86

co-mature (isoform content): 10.08% (heterogeneous)
mature (isoform content): 12.28% (heterogeneous)

biceps-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1800.0/41.0 = 43.9
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 293.0/6.0 = 48.83

co-mature (isoform content): 14.0% (heterogeneous)
mature (isoform content): 12.77% (heterogeneous)

jejunum-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 522.0/15.0 = 34.8
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 70.0/1.0 = 70.0

co-mature (isoform content): 11.82% (heterogeneous)
mature (isoform content): 6.25% (homogeneous)

whole-blood-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 261.0/13.0 = 20.08
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 34.0/4.0 = 8.5

co-mature (isoform content): 11.53% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.53% (heterogeneous)

stomach-glandular-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1437.0/86.0 = 16.71
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 241.0/8.0 = 30.13

co-mature (isoform content): 14.36% (heterogeneous)
mature (isoform content): 8.51% (homogeneous)

heart-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 3765.0/238.0 = 15.82
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1026.0/15.0 = 68.4

co-mature (isoform content): 21.42% (heterogeneous)
mature (isoform content): 5.93% (homogeneous)

ileum-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 767.0/23.0 = 33.35
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 88.0/4.0 = 22.0

co-mature (isoform content): 10.29% (heterogeneous)
mature (isoform content): 14.81% (heterogeneous)

stomach-non-glandular-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 944.0/32.0 = 29.5
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 138.0/4.0 = 34.5

co-mature (isoform content): 12.75% (heterogeneous)
mature (isoform content): 11.11% (heterogeneous)

duodenum-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 108.0/4.0 = 27.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 26.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 19.4% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

lung_rno_SRR2143331

ratio co-mature/mature: 300.0/6.0 = 50.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 38.0/2.0 = 19.0

co-mature (isoform content): 11.24% (heterogeneous)
mature (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

soleus-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2697.0/90.0 = 29.97
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 744.0/4.0 = 186.0

co-mature (isoform content): 21.62% (heterogeneous)
mature (isoform content): 4.26% (homogeneous)

stomach_rno_SRR2143340

ratio co-mature/mature: 75.0/1.0 = 75.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 15.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

ovary-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1803.0/75.0 = 24.04
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 268.0/9.0 = 29.78

co-mature (isoform content): 12.94% (heterogeneous)
mature (isoform content): 10.71% (heterogeneous)

DRG-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1799.0/58.0 = 31.02
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 91.0/4.0 = 22.75

co-mature (isoform content): 4.81% (homogeneous)
mature (isoform content): 6.45% (homogeneous)

liver2_rno_SRR2143330

ratio co-mature/mature: 36.0/0.0 = None
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 2.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 5.26% (homogeneous)
mature (isoform content): None

adrenal-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 4683.0/245.0 = 19.11
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 455.0/11.0 = 41.36

co-mature (isoform content): 8.86% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.3% (homogeneous)

brainstem-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 12469.0/466.0 = 26.76
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1267.0/25.0 = 50.68

co-mature (isoform content): 9.22% (homogeneous)
mature (isoform content): 5.09% (homogeneous)

cerebrum-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 9989.0/445.0 = 22.45
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1071.0/22.0 = 48.68

co-mature (isoform content): 9.68% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.71% (homogeneous)

kidney-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 3705.0/65.0 = 57.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 258.0/1.0 = 258.0

co-mature (isoform content): 6.51% (homogeneous)
mature (isoform content): 1.52% (homogeneous)

medulla-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2974.0/81.0 = 36.72
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 298.0/8.0 = 37.25

co-mature (isoform content): 9.11% (homogeneous)
mature (isoform content): 8.99% (homogeneous)

uterus-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 896.0/46.0 = 19.48
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 145.0/9.0 = 16.11

co-mature (isoform content): 13.93% (heterogeneous)
mature (isoform content): 16.36% (heterogeneous)

cortex-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 6434.0/136.0 = 47.31
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 460.0/6.0 = 76.67

co-mature (isoform content): 6.67% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.23% (homogeneous)

small-intestine_rno_SRR2143338

ratio co-mature/mature: 49.0/2.0 = 24.5
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 5.77% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

stomach-glandular-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1280.0/57.0 = 22.46
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 178.0/3.0 = 59.33

co-mature (isoform content): 12.21% (heterogeneous)
mature (isoform content): 5.0% (homogeneous)

hippocampus-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 13668.0/622.0 = 21.97
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1194.0/26.0 = 45.92

co-mature (isoform content): 8.03% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.01% (homogeneous)

soleus-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1116.0/21.0 = 53.14
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 252.0/4.0 = 63.0

co-mature (isoform content): 18.42% (heterogeneous)
mature (isoform content): 16.0% (heterogeneous)

duodenum-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1236.0/234.0 = 5.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 150.0/6.0 = 25.0

co-mature (isoform content): 10.82% (heterogeneous)
mature (isoform content): 2.5% (homogeneous)

pancreas-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1342.0/128.0 = 10.48
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 263.0/14.0 = 18.79

co-mature (isoform content): 16.39% (heterogeneous)
mature (isoform content): 9.86% (homogeneous)

liver-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 620.0/20.0 = 31.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 61.0/3.0 = 20.33

co-mature (isoform content): 8.96% (homogeneous)
mature (isoform content): 13.04% (heterogeneous)

pancreas_rno_SRR2143333

ratio co-mature/mature: 26.0/1.0 = 26.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 2.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 7.14% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

brain_rno_SRR2143325

ratio co-mature/mature: 1058.0/29.0 = 36.48
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 62.0/2.0 = 31.0

co-mature (isoform content): 5.54% (homogeneous)
mature (isoform content): 6.45% (homogeneous)

fat-subcutanous_rno_SRR2143326

ratio co-mature/mature: 42.0/0.0 = None
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 17.65% (heterogeneous)
mature (isoform content): None

biceps-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 964.0/25.0 = 38.56
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 116.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 10.74% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

cortex-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 432.0/18.0 = 24.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 31.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 6.7% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

liver-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1058.0/31.0 = 34.13
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 171.0/6.0 = 28.5

co-mature (isoform content): 13.91% (heterogeneous)
mature (isoform content): 16.22% (heterogeneous)

pancreas-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 908.0/75.0 = 12.11
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 236.0/14.0 = 16.86

co-mature (isoform content): 20.63% (heterogeneous)
mature (isoform content): 15.73% (heterogeneous)

soleus-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2843.0/81.0 = 35.1
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 854.0/10.0 = 85.4

co-mature (isoform content): 23.1% (heterogeneous)
mature (isoform content): 10.99% (heterogeneous)

kidney-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2441.0/81.0 = 30.14
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 192.0/3.0 = 64.0

co-mature (isoform content): 7.29% (homogeneous)
mature (isoform content): 3.57% (homogeneous)

biceps-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 663.0/13.0 = 51.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 82.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 11.01% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

duodenum-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 9888.0/505.0 = 19.58
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 857.0/16.0 = 53.56

co-mature (isoform content): 7.98% (homogeneous)
mature (isoform content): 3.07% (homogeneous)

kidney_rno_SRR2143328

ratio co-mature/mature: 371.0/3.0 = 123.67
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 2.37% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

heart_rno_SRR2143327

ratio co-mature/mature: 166.0/7.0 = 23.71
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 28.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 14.43% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

spleen_rno_SRR2143339

ratio co-mature/mature: 42.0/1.0 = 42.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 4.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 8.7% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

hippocampus-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 7953.0/376.0 = 21.15
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 688.0/16.0 = 43.0

co-mature (isoform content): 7.96% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.08% (homogeneous)

jejunum-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 507.0/25.0 = 20.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 48.0/1.0 = 48.0

co-mature (isoform content): 8.65% (homogeneous)
mature (isoform content): 3.85% (homogeneous)

cortex-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2399.0/57.0 = 42.09
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 157.0/4.0 = 39.25

co-mature (isoform content): 6.14% (homogeneous)
mature (isoform content): 6.56% (homogeneous)

DRG-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 1621.0/93.0 = 17.43
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 129.0/2.0 = 64.5

co-mature (isoform content): 7.37% (homogeneous)
mature (isoform content): 2.11% (homogeneous)

testes_rno_SRR2143341

ratio co-mature/mature: 31.0/0.0 = None
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 0.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
mature (isoform content): None

cerebrum-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 11562.0/694.0 = 16.66
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1185.0/29.0 = 40.86

co-mature (isoform content): 9.3% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.01% (homogeneous)

thymus_rno_SRR2143342

ratio co-mature/mature: 103.0/1.0 = 103.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 8.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 7.21% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

cortex-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 5199.0/130.0 = 39.99
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 347.0/9.0 = 38.56

co-mature (isoform content): 6.26% (homogeneous)
mature (isoform content): 6.47% (homogeneous)

cerebellum-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 4915.0/237.0 = 20.74
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 574.0/8.0 = 71.75

co-mature (isoform content): 10.46% (heterogeneous)
mature (isoform content): 3.27% (homogeneous)

soleus-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 426.0/19.0 = 22.42
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 156.0/2.0 = 78.0

co-mature (isoform content): 26.8% (heterogeneous)
mature (isoform content): 9.52% (homogeneous)

heart-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2641.0/132.0 = 20.01
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 756.0/17.0 = 44.47

co-mature (isoform content): 22.25% (heterogeneous)
mature (isoform content): 11.41% (heterogeneous)

kidney-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 5452.0/123.0 = 44.33
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 394.0/9.0 = 43.78

co-mature (isoform content): 6.74% (homogeneous)
mature (isoform content): 6.82% (homogeneous)

medulla-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 4763.0/110.0 = 43.3
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 454.0/10.0 = 45.4

co-mature (isoform content): 8.7% (homogeneous)
mature (isoform content): 8.33% (homogeneous)

brainstem-female_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 10156.0/673.0 = 15.09
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1075.0/18.0 = 59.72

co-mature (isoform content): 9.57% (homogeneous)
mature (isoform content): 2.6% (homogeneous)

large-intestine_rno_SRR2143329

ratio co-mature/mature: 276.0/5.0 = 55.2
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 39.0/1.0 = 39.0

co-mature (isoform content): 12.38% (heterogeneous)
mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

liver1_rno_SRR768350

ratio co-mature/mature: 56.0/170.0 = 0.33
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 2.0/4.0 = 0.5

co-mature (isoform content): 3.45% (homogeneous)
mature (isoform content): 2.3% (homogeneous)

liver-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 158.0/3.0 = 52.67
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 26.0/2.0 = 13.0

co-mature (isoform content): 14.13% (heterogeneous)
mature (isoform content): 40.0% (heterogeneous)

brainstem-male-homogenized5in1_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 2070.0/97.0 = 21.34
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 193.0/5.0 = 38.6

co-mature (isoform content): 8.53% (homogeneous)
mature (isoform content): 4.9% (homogeneous)

muscle_rno_SRR2143332

ratio co-mature/mature: 317.0/2.0 = 158.5
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 22.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 6.49% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

ileum-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 692.0/19.0 = 36.42
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 82.0/3.0 = 27.33

co-mature (isoform content): 10.59% (heterogeneous)
mature (isoform content): 13.64% (heterogeneous)

duodenum-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 195.0/6.0 = 32.5
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 20.0/1.0 = 20.0

co-mature (isoform content): 9.3% (homogeneous)
mature (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

testes-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 294.0/22.0 = 13.36
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 61.0/3.0 = 20.33

co-mature (isoform content): 17.18% (heterogeneous)
mature (isoform content): 12.0% (heterogeneous)

cerebellum-male_rno_PRJNA312384

ratio co-mature/mature: 4487.0/225.0 = 19.94
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 500.0/10.0 = 50.0

co-mature (isoform content): 10.03% (heterogeneous)
mature (isoform content): 4.26% (homogeneous)

skin_rno_SRR2143337

ratio co-mature/mature: 119.0/1.0 = 119.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 13.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 9.85% (homogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Reads

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