Rno-Mir-142-P2-v2

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brain_rno_SRR2143325	SRR2143325	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
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small-intestine_rno_SRR2143338	SRR2143338	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
spleen_rno_SRR2143339	SRR2143339	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
stomach_rno_SRR2143340	SRR2143340	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
testes_rno_SRR2143341	SRR2143341	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
thymus_rno_SRR2143342	SRR2143342	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26341662
liver1_rno_SRR768350	SRR768350	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24472605

Rno-Mir-142-P2-v2

kidney-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 572.0/8126.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 123.0/631.0 = 0.19

mature (isoform content): 17.7% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.21% (homogeneous)

liver-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 877.0/9448.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 179.0/680.0 = 0.26

mature (isoform content): 16.95% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.71% (homogeneous)

biceps-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 237.0/4774.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 67.0/307.0 = 0.22

mature (isoform content): 22.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.04% (homogeneous)

biceps-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 337.0/7238.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 66.0/403.0 = 0.16

mature (isoform content): 16.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.27% (homogeneous)

jejunum-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 3088.0/39423.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 622.0/2520.0 = 0.25

mature (isoform content): 16.77% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.01% (homogeneous)

whole-blood-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 5317.0/55699.0 = 0.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 798.0/2790.0 = 0.29

mature (isoform content): 13.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.77% (homogeneous)

stomach-glandular-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1189.0/16219.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 226.0/871.0 = 0.26

mature (isoform content): 15.97% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.1% (homogeneous)

heart-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 2655.0/32432.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 408.0/1791.0 = 0.23

mature (isoform content): 13.32% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.23% (homogeneous)

ileum-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 4083.0/52372.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 914.0/3356.0 = 0.27

mature (isoform content): 18.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.02% (homogeneous)

stomach-non-glandular-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 189.0/3583.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 32.0/222.0 = 0.14

mature (isoform content): 14.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.83% (homogeneous)

duodenum-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 607.0/6666.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 114.0/441.0 = 0.26

mature (isoform content): 15.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.21% (homogeneous)

lung_rno_SRR2143331

ratio mature/star: 197.0/6175.0 = 0.03
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 34.0/247.0 = 0.14

mature (isoform content): 14.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.85% (homogeneous)

soleus-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 527.0/7586.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 88.0/438.0 = 0.2

mature (isoform content): 14.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.46% (homogeneous)

stomach_rno_SRR2143340

ratio mature/star: 16.0/287.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7.0/6.0 = 1.17

mature (isoform content): 30.43% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.05% (homogeneous)

ovary-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1588.0/16215.0 = 0.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 375.0/998.0 = 0.38

mature (isoform content): 19.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.8% (homogeneous)

DRG-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 252.0/4167.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 30.0/221.0 = 0.14

mature (isoform content): 10.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.04% (homogeneous)

liver2_rno_SRR2143330

ratio mature/star: 96.0/1796.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 36.0/44.0 = 0.82

mature (isoform content): 27.27% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.39% (homogeneous)

adrenal-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 648.0/9211.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 128.0/591.0 = 0.22

mature (isoform content): 16.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.03% (homogeneous)

brainstem-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 662.0/9182.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 104.0/644.0 = 0.16

mature (isoform content): 13.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.55% (homogeneous)

cerebrum-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 432.0/7457.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 78.0/391.0 = 0.2

mature (isoform content): 15.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.98% (homogeneous)

kidney-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 775.0/10723.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 142.0/656.0 = 0.22

mature (isoform content): 15.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.77% (homogeneous)

medulla-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1243.0/17111.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 214.0/1342.0 = 0.16

mature (isoform content): 14.69% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.27% (homogeneous)

uterus-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1342.0/16547.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 286.0/970.0 = 0.29

mature (isoform content): 17.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.54% (homogeneous)

cortex-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1406.0/20751.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 290.0/1236.0 = 0.23

mature (isoform content): 17.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.62% (homogeneous)

small-intestine_rno_SRR2143338

ratio mature/star: 35.0/935.0 = 0.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6.0/36.0 = 0.17

mature (isoform content): 14.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.71% (homogeneous)

stomach-glandular-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 628.0/9281.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 121.0/568.0 = 0.21

mature (isoform content): 16.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.77% (homogeneous)

hippocampus-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 859.0/12640.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 141.0/728.0 = 0.19

mature (isoform content): 14.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.45% (homogeneous)

soleus-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 195.0/3097.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 29.0/149.0 = 0.19

mature (isoform content): 12.95% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.59% (homogeneous)

duodenum-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 510.0/5780.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 106.0/294.0 = 0.36

mature (isoform content): 17.21% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.84% (homogeneous)

pancreas-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1194.0/11273.0 = 0.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 280.0/407.0 = 0.69

mature (isoform content): 19.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.48% (homogeneous)

liver-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 2692.0/38167.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 582.0/2051.0 = 0.28

mature (isoform content): 17.78% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.1% (homogeneous)

pancreas_rno_SRR2143333

ratio mature/star: 74.0/1499.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28.0/24.0 = 1.17

mature (isoform content): 27.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 1.58% (homogeneous)

brain_rno_SRR2143325

ratio mature/star: 22.0/516.0 = 0.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/21.0 = 0.14

mature (isoform content): 12.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.91% (homogeneous)

fat-subcutanous_rno_SRR2143326

ratio mature/star: 217.0/8357.0 = 0.03
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 61.0/324.0 = 0.19

mature (isoform content): 21.94% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.73% (homogeneous)

biceps-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 229.0/3257.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 61.0/180.0 = 0.34

mature (isoform content): 21.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.24% (homogeneous)

cortex-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 189.0/2513.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 30.0/179.0 = 0.17

mature (isoform content): 13.7% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.65% (homogeneous)

liver-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 4205.0/61436.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 903.0/3352.0 = 0.27

mature (isoform content): 17.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.17% (homogeneous)

pancreas-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1464.0/13250.0 = 0.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 336.0/503.0 = 0.67

mature (isoform content): 18.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.66% (homogeneous)

soleus-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 584.0/7623.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 121.0/413.0 = 0.29

mature (isoform content): 17.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.14% (homogeneous)

kidney-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 660.0/7376.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 113.0/568.0 = 0.2

mature (isoform content): 14.62% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.15% (homogeneous)

biceps-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 82.0/2107.0 = 0.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18.0/114.0 = 0.16

mature (isoform content): 18.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.13% (homogeneous)

duodenum-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1179.0/14384.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 220.0/882.0 = 0.25

mature (isoform content): 15.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.78% (homogeneous)

kidney_rno_SRR2143328

ratio mature/star: 38.0/466.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9.0/15.0 = 0.6

mature (isoform content): 19.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.12% (homogeneous)

heart_rno_SRR2143327

ratio mature/star: 27.0/860.0 = 0.03
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/15.0 = 0.27

mature (isoform content): 12.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 1.71% (homogeneous)

spleen_rno_SRR2143339

ratio mature/star: 1164.0/16444.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 281.0/396.0 = 0.71

mature (isoform content): 19.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.35% (homogeneous)

hippocampus-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1107.0/13670.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 213.0/811.0 = 0.26

mature (isoform content): 16.14% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.6% (homogeneous)

jejunum-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 2909.0/35355.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 624.0/2261.0 = 0.28

mature (isoform content): 17.66% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.01% (homogeneous)

cortex-female-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 479.0/6966.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 102.0/464.0 = 0.22

mature (isoform content): 17.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.24% (homogeneous)

DRG-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 257.0/4550.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28.0/288.0 = 0.1

mature (isoform content): 9.82% (homogeneous)
star (isoform content): 5.95% (homogeneous)

testes_rno_SRR2143341

ratio mature/star: 5.0/119.0 = 0.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/2.0 = 1.0

mature (isoform content): 28.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 1.65% (homogeneous)

cerebrum-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 576.0/10043.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 103.0/517.0 = 0.2

mature (isoform content): 15.17% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.9% (homogeneous)

thymus_rno_SRR2143342

ratio mature/star: 5078.0/53894.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1394.0/1264.0 = 1.1

mature (isoform content): 21.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.29% (homogeneous)

cortex-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1154.0/16258.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 193.0/974.0 = 0.2

mature (isoform content): 14.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.65% (homogeneous)

cerebellum-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 307.0/4335.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 39.0/247.0 = 0.16

mature (isoform content): 11.27% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.39% (homogeneous)

soleus-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 71.0/1143.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 17.0/50.0 = 0.34

mature (isoform content): 19.32% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.19% (homogeneous)

heart-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1861.0/19845.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 318.0/1268.0 = 0.25

mature (isoform content): 14.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.01% (homogeneous)

kidney-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1127.0/18148.0 = 0.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 198.0/1198.0 = 0.17

mature (isoform content): 14.94% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.19% (homogeneous)

medulla-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1931.0/28673.0 = 0.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 365.0/1912.0 = 0.19

mature (isoform content): 15.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.25% (homogeneous)

brainstem-female_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 730.0/8629.0 = 0.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 114.0/546.0 = 0.21

mature (isoform content): 13.51% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.95% (homogeneous)

large-intestine_rno_SRR2143329

ratio mature/star: 146.0/2782.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 20.0/95.0 = 0.21

mature (isoform content): 12.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.3% (homogeneous)

liver1_rno_SRR768350

ratio mature/star: 4846.0/701.0 = 6.91
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 266.0/64.0 = 4.16

mature (isoform content): 5.2% (homogeneous)
star (isoform content): 8.37% (homogeneous)

liver-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 1010.0/11558.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 192.0/751.0 = 0.26

mature (isoform content): 15.97% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.1% (homogeneous)

brainstem-male-homogenized5in1_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 151.0/1708.0 = 0.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18.0/101.0 = 0.18

mature (isoform content): 10.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.58% (homogeneous)

muscle_rno_SRR2143332

ratio mature/star: 26.0/792.0 = 0.03
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mature (isoform content): 18.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.34% (homogeneous)

ileum-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 2754.0/32972.0 = 0.08
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mature (isoform content): 19.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.22% (homogeneous)

duodenum-male-homogenized_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 830.0/9171.0 = 0.09
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mature (isoform content): 16.33% (heterogeneous)
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testes-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 105.0/1336.0 = 0.08
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mature (isoform content): 33.54% (heterogeneous)
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cerebellum-male_rno_PRJNA312384

ratio mature/star: 317.0/4215.0 = 0.08
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mature (isoform content): 14.78% (heterogeneous)
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skin_rno_SRR2143337

ratio mature/star: 53.0/848.0 = 0.06
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mature (isoform content): 19.7% (heterogeneous)
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Reads

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