Ocu-Mir-154-P34

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Ocu-Mir-154-P34

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total-animal_ocu

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cerebellum_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
testis_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
kidney_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
hypothalamus_cfa_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
cortex_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
wholebrain_ocu_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
testis2_cfa_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
heart_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
cortex_cfa_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
kidney2_cfa_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
testis_ocu_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
cerebellum_cfa_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
hypothalamus_bta_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
kidney_ocu_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
heart_ocu_PRJNA432546	PRJNA432546	https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006
total-animal_ocu	NA	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26733575