reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

References
Tissue	Paper	Accesion
total-animal1_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal2_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animals_bpl_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal3_ple_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
pooled-animal_sne_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal1_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal2_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal1_ple_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal2_ple_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal1_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full
total-animal2_nag_PRJNA1127840	PRJNA1127840	https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.01.605096v2.full

Nag-Mir-12593-v1

Relative expression

Relative expression

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 712.45/127.22 = 5.6

Global results

ratio mature/star: 712.45/127.22 = 5.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 458.0/0.0 = None

mature (isoform content): 39.13% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Show details:

total-animal1_nag_PRJNA1127840

ratio mature/star: 28.0/5.0 = 5.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18.0/0.0 = None

mature (isoform content): 39.13% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

total-animal1_nag_PRJNA1127840

ratio mature/star: 28.0/5.0 = 5.6

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		7	178.11	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		14	356.23	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	50.89	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	C	A	G	C	U	U	C	G	C	A	A	G	G	G	A	U	A	A	U	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		5	127.22	Nag-Mir-12593-v2
U	C	A	G	A	G	G	G	C	A	U	C	A	U	G	G	C	G	U	G	A	A	C	C	G	U	C	A	G	C	G	C	A	G	C	U	U	C	G	C	A	A	G	G	G	A	U	A	A	U	G	U	G	A	C	G	A	A	U	A	A	A	G	G	U	G	U	C	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	A	A	U	C	G	U	U	U	G	U	G	C	U	C	A	A	U	U	A	G	G	U	C	C	G	U	A	G	A

download reads

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		7	178.11	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		14	356.23	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	50.89	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	C	A	G	C	U	U	C	G	C	A	A	G	G	G	A	U	A	A	U	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		5	127.22	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	50.89	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		4	101.78	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	50.89	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	76.33	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	25.44	Nag-Mir-12593-v2
U	C	A	G	A	G	G	G	C	A	U	C	A	U	G	G	C	G	U	G	A	A	C	C	G	U	C	A	G	C	G	C	A	G	C	U	U	C	G	C	A	A	G	G	G	A	U	A	A	U	G	U	G	A	C	G	A	A	U	A	A	A	G	G	U	G	U	C	A	C	A	U	U	C	U	C	U	U	A	C	G	U	A	G	U	G	G	C	G	U	U	A	A	U	C	G	U	U	U	G	U	G	C	U	C	A	A	U	U	A	G	G	U	C	C	G	U	A	G	A

download reads

download reads