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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

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notospermus_llo_SRX19590907	SRX19590907	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/
notospermus_llo_SRX19590908	SRX19590908	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/
notospermus_llo_SRX19590909	SRX19590909	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/
notospermus_llo_SRX19590910	SRX19590910	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/
notospermus_llo_SRX19590911	SRX19590911	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/
notospermus_llo_SRX19590912	SRX19590912	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38713108/