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Gmo-Mir-9-P4b

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

intestine_gmo_SRR2039404

ratio mature/star: 108.0/2.0 = 54.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 36.0/805.0 = 0.04

mature (isoform content): 25.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.75% (heterogeneous)

spleen_gmo_SRR2039437

ratio mature/star: 1159.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 329.0/105.0 = 3.13

mature (isoform content): 22.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

white-muscle_gmo_SRR2039265

ratio mature/star: 11.0/1.0 = 11.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/45.0 = 0.04

mature (isoform content): 15.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 97.83% (heterogeneous)

gills_gmo_SRR2039267

ratio mature/star: 53.0/4.0 = 13.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 13.0/129.0 = 0.1

mature (isoform content): 19.7% (heterogeneous)
star (isoform content): 96.99% (heterogeneous)

brain_gmo_SRR2039435

ratio mature/star: 116652.0/23482.0 = 4.97
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 33770.0/71961.0 = 0.47

mature (isoform content): 22.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 75.4% (heterogeneous)

skin_gmo_SRR2039332

ratio mature/star: 45.0/2.0 = 22.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7.0/135.0 = 0.05

mature (isoform content): 13.46% (heterogeneous)
star (isoform content): 98.54% (heterogeneous)

head-kidney_gmo_SRR2039266

ratio mature/star: 47.0/1.0 = 47.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15.0/161.0 = 0.09

mature (isoform content): 24.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.38% (heterogeneous)

liver_gmo_SRR2039436

ratio mature/star: 28.0/1.0 = 28.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12.0/16.0 = 0.75

mature (isoform content): 30.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 94.12% (heterogeneous)

intestine_gmo_SRR2039404

ratio mature/star: 108.0/2.0 = 54.0

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ratio mature/star: 1159.0/0.0 = None

white-muscle_gmo_SRR2039265

ratio mature/star: 11.0/1.0 = 11.0

gills_gmo_SRR2039267

ratio mature/star: 53.0/4.0 = 13.25

brain_gmo_SRR2039435

ratio mature/star: 116652.0/23482.0 = 4.97

skin_gmo_SRR2039332

ratio mature/star: 45.0/2.0 = 22.5

head-kidney_gmo_SRR2039266

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liver_gmo_SRR2039436

ratio mature/star: 28.0/1.0 = 28.0

Reads

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.63	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	1.26	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.63	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.63	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	C	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.63	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	0.94	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	11	3.46	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	10	3.14	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.63	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	106	33.33	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	19	5.98	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	573	180.41	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	1.26	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	14	4.38	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5	1.57	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	46	14.37	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	27	8.51	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	G	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	337	105.96	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	0.94	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	G	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	G	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	9	2.83	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6	1.89	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	33	10.35	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	11	3.46	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	U	A	U	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	U	U	G	G	U	U	A	U	C	U	A	G	C	U	G	C	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.31	Gmo-Mir-9-P3a, Gmo-Mir-9-P3b, ...
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References
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