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embryo_gga	NA	NA

Gga-Mir-140-P2-v1

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

adipose-male_gga_ERR1193577

ratio mature/star: 41999.0/997.0 = 42.13
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 62300.0/497.0 = 125.35

mature (isoform content): 59.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.27% (heterogeneous)

proventriculus-male_gga_ERR1193599

ratio mature/star: 33924.0/1709.0 = 19.85
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 46710.0/656.0 = 71.2

mature (isoform content): 57.93% (heterogeneous)
star (isoform content): 27.74% (heterogeneous)

spleen-female_gga_ERR1193602

ratio mature/star: 37191.0/1898.0 = 19.59
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 65413.0/1024.0 = 63.88

mature (isoform content): 63.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 35.04% (heterogeneous)

adipose-female_gga_ERR1193578

ratio mature/star: 74506.0/2018.0 = 36.92
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 108147.0/1021.0 = 105.92

mature (isoform content): 59.21% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.6% (heterogeneous)

heart-female_gga_ERR1193586

ratio mature/star: 2221.0/92.0 = 24.14
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5063.0/43.0 = 117.74

mature (isoform content): 69.51% (heterogeneous)
star (isoform content): 31.85% (heterogeneous)

heart-male_gga_ERR1193585

ratio mature/star: 7564.0/323.0 = 23.42
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14876.0/109.0 = 136.48

mature (isoform content): 66.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.23% (heterogeneous)

kidney-male_gga_ERR1193589

ratio mature/star: 12431.0/671.0 = 18.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 23794.0/221.0 = 107.67

mature (isoform content): 65.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 24.78% (heterogeneous)

lung-male_gga_ERR1193593

ratio mature/star: 31816.0/1093.0 = 29.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 52601.0/453.0 = 116.12

mature (isoform content): 62.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 29.3% (heterogeneous)

liver-female_gga_ERR1193592

ratio mature/star: 23316.0/1306.0 = 17.85
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 53652.0/767.0 = 69.95

mature (isoform content): 69.71% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.0% (heterogeneous)

kidney-female_gga_ERR1193590

ratio mature/star: 8339.0/328.0 = 25.42
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15785.0/111.0 = 142.21

mature (isoform content): 65.43% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.28% (heterogeneous)

breast-muscle-male_gga_ERR1193595

ratio mature/star: 14858.0/493.0 = 30.14
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 27339.0/232.0 = 117.84

mature (isoform content): 64.79% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.0% (heterogeneous)

cerebrum-male_gga_ERR1193579

ratio mature/star: 39549.0/1245.0 = 31.77
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 69982.0/387.0 = 180.83

mature (isoform content): 63.89% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.71% (heterogeneous)

cerebellum-female_gga_ERR1193582

ratio mature/star: 70629.0/2438.0 = 28.97
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 94888.0/699.0 = 135.75

mature (isoform content): 57.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.28% (heterogeneous)

sciatic-nerve-male_gga_ERR1193597

ratio mature/star: 36483.0/472.0 = 77.29
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 44145.0/187.0 = 236.07

mature (isoform content): 54.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.38% (heterogeneous)

spleen-male_gga_ERR1193601

ratio mature/star: 31799.0/1560.0 = 20.38
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 57437.0/763.0 = 75.28

mature (isoform content): 64.37% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.85% (heterogeneous)

ovary_gga_ERR1193584

ratio mature/star: 25852.0/879.0 = 29.41
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41449.0/436.0 = 95.07

mature (isoform content): 61.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.16% (heterogeneous)

sciatic-nerve-female_gga_ERR1193598

ratio mature/star: 37163.0/987.0 = 37.65
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 45758.0/359.0 = 127.46

mature (isoform content): 55.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 26.67% (heterogeneous)

testis_gga_ERR1193583

ratio mature/star: 4907.0/296.0 = 16.58
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7074.0/87.0 = 81.31

mature (isoform content): 59.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.72% (heterogeneous)

cerebellum-male_gga_ERR1193581

ratio mature/star: 78977.0/2109.0 = 37.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 85274.0/735.0 = 116.02

mature (isoform content): 51.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.84% (heterogeneous)

cerebrum-female_gga_ERR1193580

ratio mature/star: 20532.0/242.0 = 84.84
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 27691.0/91.0 = 304.3

mature (isoform content): 57.42% (heterogeneous)
star (isoform content): 27.33% (heterogeneous)

hypothalamus-female_gga_ERR1193588

ratio mature/star: 30477.0/510.0 = 59.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 40663.0/160.0 = 254.14

mature (isoform content): 57.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.88% (heterogeneous)

adrenal-gland-male_gga_ERR1193576

ratio mature/star: 199636.0/5720.0 = 34.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 268883.0/1760.0 = 152.77

mature (isoform content): 57.39% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.53% (heterogeneous)

hypothalamus-male_gga_ERR1193587

ratio mature/star: 37523.0/976.0 = 38.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41146.0/289.0 = 142.37

mature (isoform content): 52.3% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.85% (heterogeneous)

liver-male_gga_ERR1193591

ratio mature/star: 32324.0/2068.0 = 15.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 85925.0/1134.0 = 75.77

mature (isoform content): 72.66% (heterogeneous)
star (isoform content): 35.42% (heterogeneous)

breast-muscle-female_gga_ERR1193596

ratio mature/star: 13279.0/600.0 = 22.13
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 31338.0/297.0 = 105.52

mature (isoform content): 70.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.11% (heterogeneous)

gga_embryo

ratio mature/star: 2270201.0/106252.0 = 21.37
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 260866.0/11090.0 = 23.52

mature (isoform content): 10.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.45% (homogeneous)

proventriculus-female_gga_ERR1193600

ratio mature/star: 18945.0/739.0 = 25.64
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 24181.0/283.0 = 85.45

mature (isoform content): 56.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 27.69% (heterogeneous)

lung-female_gga_ERR1193594

ratio mature/star: 73017.0/2656.0 = 27.49
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 135966.0/1186.0 = 114.64

mature (isoform content): 65.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.87% (heterogeneous)

adipose-male_gga_ERR1193577

ratio mature/star: 41999.0/997.0 = 42.13

proventriculus-male_gga_ERR1193599

ratio mature/star: 33924.0/1709.0 = 19.85

spleen-female_gga_ERR1193602

ratio mature/star: 37191.0/1898.0 = 19.59

adipose-female_gga_ERR1193578

ratio mature/star: 74506.0/2018.0 = 36.92

heart-female_gga_ERR1193586

ratio mature/star: 2221.0/92.0 = 24.14

heart-male_gga_ERR1193585

ratio mature/star: 7564.0/323.0 = 23.42

kidney-male_gga_ERR1193589

ratio mature/star: 12431.0/671.0 = 18.53

lung-male_gga_ERR1193593

ratio mature/star: 31816.0/1093.0 = 29.11

liver-female_gga_ERR1193592

ratio mature/star: 23316.0/1306.0 = 17.85

kidney-female_gga_ERR1193590

ratio mature/star: 8339.0/328.0 = 25.42

breast-muscle-male_gga_ERR1193595

ratio mature/star: 14858.0/493.0 = 30.14

cerebrum-male_gga_ERR1193579

ratio mature/star: 39549.0/1245.0 = 31.77

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ratio mature/star: 36483.0/472.0 = 77.29

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