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Csc-Mir-279-P9b

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

female-prosoma_csc_SRR5602514

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mature (isoform content): 26.63% (heterogeneous)
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Tissue	Paper	Accesion
female-germline_csc_SRR5602513	SRR5602513	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma_csc_SRR5602514	SRR5602514	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-germline_csc_SRR5958548	SRR5958548	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-prosoma_csc_SRR5958578	SRR5958578	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-prosoma2_csc_SRR5958582	SRR5958582	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma1_csc_SRR5958583	SRR5958583	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma2_csc_SRR5958586	SRR5958586	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/