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References
Tissue	Paper	Accesion
late-embryo_cin_SRR014355	SRR014355	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19151725
larva_cin_SRR038843	SRR038843	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20370911
gastrula_cin_SRR038844	SRR038844	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20370911
C-robusta-0-days-immediately-post-amputation1_cin_SRR3953077	SRR3953077	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-0-days-immediately-post-amputation2_cin_SRR3953078	SRR3953078	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-0-days-immediately-post-amputation3_cin_SRR3953079	SRR3953079	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-1-day-post-amputation1_cin_SRR3953080	SRR3953080	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-1-day-post-amputation2_cin_SRR3953081	SRR3953081	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082	SRR3953082	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-3-days-post-amputation1_cin_SRR3953083	SRR3953083	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-3-days-post-amputation2_cin_SRR3953084	SRR3953084	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-3-days-post-amputation3_cin_SRR3953085	SRR3953085	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214
C-robusta-8-days-post-amputation_cin_SRR3953086	SRR3953086	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28432214