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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
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C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

ratio mature/star: 78833.0/14.0 = 5630.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2704.0/12.0 = 225.33

mature (isoform content): 3.32% (homogeneous)
star (isoform content): 46.15% (heterogeneous)

C-robusta-8-days-post-amputation_cin_SRR3953086

ratio mature/star: 212292.0/23.0 = 9230.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 20411.0/13.0 = 1570.08

mature (isoform content): 8.77% (homogeneous)
star (isoform content): 36.11% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation2_cin_SRR3953078

ratio mature/star: 68577.0/7.0 = 9796.71
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7150.0/2.0 = 3575.0

mature (isoform content): 9.44% (homogeneous)
star (isoform content): 22.22% (heterogeneous)

gastrula_cin_SRR038844

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 135.0/0.0 = None

mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): None

C-robusta-3-days-post-amputation2_cin_SRR3953084

ratio mature/star: 63931.0/14.0 = 4566.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2082.0/10.0 = 208.2

mature (isoform content): 3.15% (homogeneous)
star (isoform content): 41.67% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation1_cin_SRR3953077

ratio mature/star: 123504.0/12.0 = 10292.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 16506.0/1.0 = 16506.0

mature (isoform content): 11.79% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.69% (homogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation3_cin_SRR3953085

ratio mature/star: 166779.0/12.0 = 13898.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 13624.0/10.0 = 1362.4

mature (isoform content): 7.55% (homogeneous)
star (isoform content): 45.45% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation1_cin_SRR3953080

ratio mature/star: 62655.0/13.0 = 4819.62
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6118.0/0.0 = None

mature (isoform content): 8.9% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

late-embryo_cin_SRR014355

ratio mature/star: 403.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 32.0/0.0 = None

mature (isoform content): 7.36% (homogeneous)
star (isoform content): None

larva_cin_SRR038843

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1683.0/0.0 = None

mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): None

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation3_cin_SRR3953079

ratio mature/star: 138312.0/14.0 = 9879.43
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 19125.0/2.0 = 9562.5

mature (isoform content): 12.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.5% (heterogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation1_cin_SRR3953083

ratio mature/star: 112636.0/29.0 = 3884.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9384.0/6.0 = 1564.0

mature (isoform content): 7.69% (homogeneous)
star (isoform content): 17.14% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation2_cin_SRR3953081

ratio mature/star: 177335.0/19.0 = 9333.42
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11597.0/12.0 = 966.42

mature (isoform content): 6.14% (homogeneous)
star (isoform content): 38.71% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	C	A	A	U	G	A	A	A	G	U	A	G	A	U	G	U	C	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	30	8.54
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	C	A	A	U	G	A	A	A	G	U	A	G	A	U	G	U	C	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	3.99
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