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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 173498.36/380.43 = 456.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 16402.63/28.73 = 571.01

mature (isoform content): 8.64% (homogeneous)
star (isoform content): 7.02% (homogeneous)

young-adult-male_cel_SRR585537

ratio mature/star: 115294.0/51.0 = 2260.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3039.0/2.0 = 1519.5

mature (isoform content): 2.57% (homogeneous)
star (isoform content): 3.77% (homogeneous)

wild-type_cel_SRR6112539

ratio mature/star: 776928.0/3077.0 = 252.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12410.0/250.0 = 49.64

mature (isoform content): 1.57% (homogeneous)
star (isoform content): 7.51% (homogeneous)

dauer-stage_cel_PRJNA176827

ratio mature/star: 244933.0/767.0 = 319.34
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 55568.0/15.0 = 3704.53

mature (isoform content): 18.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 1.92% (homogeneous)

mixed-stages_cel_PRJNA176827

ratio mature/star: 162564.0/243.0 = 668.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 48025.0/5.0 = 9605.0

mature (isoform content): 22.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.02% (homogeneous)

young-adult-hermaphrodite_cel_SRR585535

ratio mature/star: 51601.0/937.0 = 55.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2707.0/128.0 = 21.15

mature (isoform content): 4.98% (homogeneous)
star (isoform content): 12.02% (heterogeneous)

early-embryo_cel_SRR585536

ratio mature/star: 28254.0/6.0 = 4709.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 559.0/0.0 = None

mature (isoform content): 1.94% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

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References
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