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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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embryo-day-0-1_bge_SRR4252607	SRR4252607	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Mir-965

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 38.0/1.0 = 38.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12.0/6.0 = 2.0

mature (isoform content): 24.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 85.71% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 634.0/8.0 = 79.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 102.0/4.0 = 25.5

mature (isoform content): 13.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 97.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18.0/0.0 = None

mature (isoform content): 15.65% (heterogeneous)
star (isoform content): None

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 73.0/3.0 = 24.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9.0/4.0 = 2.25

mature (isoform content): 10.98% (heterogeneous)
star (isoform content): 57.14% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 345.0/5.0 = 69.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 76.0/1.0 = 76.0

mature (isoform content): 18.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 265.0/5.0 = 53.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 67.0/3.0 = 22.33

mature (isoform content): 20.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.5% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 497.0/1.0 = 497.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 68.0/0.0 = None

mature (isoform content): 12.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 2349.0/39.0 = 60.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 337.0/20.0 = 16.85

mature (isoform content): 12.55% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.9% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 650.0/2.0 = 325.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 63.0/1.0 = 63.0

mature (isoform content): 8.84% (homogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 1705.0/2.0 = 852.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 71.0/7.0 = 10.14

mature (isoform content): 4.0% (homogeneous)
star (isoform content): 77.78% (heterogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 6.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/0.0 = None

mature (isoform content): 33.33% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 365.0/1.0 = 365.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 59.0/1.0 = 59.0

mature (isoform content): 13.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 108.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14.0/0.0 = None

mature (isoform content): 11.48% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 444.0/3.0 = 148.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 34.0/0.0 = None

mature (isoform content): 7.11% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 15.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/2.0 = 1.0

mature (isoform content): 11.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 95.0/1.0 = 95.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 16.0/0.0 = None

mature (isoform content): 14.41% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 790.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 24.0/0.0 = None

mature (isoform content): 2.95% (homogeneous)
star (isoform content): None

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 330.0/3.0 = 110.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 40.0/1.0 = 40.0

mature (isoform content): 10.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 10.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/0.0 = None

mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 275.0/1.0 = 275.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 49.0/0.0 = None

mature (isoform content): 15.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 128.0/4.0 = 32.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5.0/3.0 = 1.67

mature (isoform content): 3.76% (homogeneous)
star (isoform content): 42.86% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 4.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 50.0/3.0 = 16.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/1.0 = 3.0

mature (isoform content): 5.66% (homogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 57.0/1.0 = 57.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11.0/0.0 = None

mature (isoform content): 16.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 467.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 22.0/0.0 = None

mature (isoform content): 4.5% (homogeneous)
star (isoform content): None

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 277.0/4.0 = 69.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 24.0/0.0 = None

mature (isoform content): 7.97% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 316.0/5.0 = 63.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 39.0/0.0 = None

mature (isoform content): 10.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 38.0/1.0 = 38.0

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 634.0/8.0 = 79.25

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 97.0/0.0 = None

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 73.0/3.0 = 24.33

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 345.0/5.0 = 69.0

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 265.0/5.0 = 53.0

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 497.0/1.0 = 497.0

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ratio mature/star: 2349.0/39.0 = 60.23

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 650.0/2.0 = 325.0

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 1705.0/2.0 = 852.5

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ratio mature/star: 6.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 365.0/1.0 = 365.0

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ratio mature/star: 108.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 444.0/3.0 = 148.0

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ratio mature/star: 15.0/0.0 = None

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 95.0/1.0 = 95.0

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ratio mature/star: 330.0/3.0 = 110.0

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ratio mature/star: 10.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 128.0/4.0 = 32.0

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ratio mature/star: 4.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 50.0/3.0 = 16.67

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ratio mature/star: 57.0/1.0 = 57.0

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