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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 131.0/11.39 = 11.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 79.74/8.54 = 9.33

mature (isoform content): 37.84% (heterogeneous)
star (isoform content): 42.86% (heterogeneous)

skeletal_muscle

ratio mature/star: 46.0/4.0 = 11.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28.0/3.0 = 9.33

mature (isoform content): 37.84% (heterogeneous)
star (isoform content): 42.86% (heterogeneous)

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References
Tissue	Paper	Accesion
skeletal muscle	Hutchins et al. 2016	SRR1918200
whole brain	Hutchins et al. 2016	SRR1918201
25 day regenerating tail base	Hutchins et al. 2016	SRR1918202, SRR1918204, SRR1918205
25 day regenerating tail tip	Hutchins et al. 2016	SRR1918206
total animal	Lyson et al. 2012	na