MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUCAAA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-888 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-506-P9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 139702265-139702321 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P9) |
Mir-506-P13
chrX: 139700246-139700302 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P10 chrX: 139701739-139701795 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P9 chrX: 139702265-139702321 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P11 chrX: 139703819-139703875 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P12 chrX: 139704349-139704405 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAAUUAGCCAUGUCGUGGGCAGUGCCCUACUCAAAAAGCUGUCAGUCACUUAUGUUACAUGUGACUGACACCUCUUUAGAUGAAGGAAGGCUCAUCAAGUACAGUUUUGUGGUGGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAAUUAGCCAUGUC--| AGUG CUAC - A C UUAUG GUGGGC CC UC AAA AG UGUCAGUCAC \ UACUCG GG AG UUU UC ACAGUCAGUG U GUGGUGUUUUGACAUGAAC^ GAA- AAGU A C C UACAU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P9_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0006527 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCAAAAAGCUGUCAGUCAC -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-888 |
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Star sequence | Mml-Mir-506-P9_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- GACUGACACCUCUUUAGAUGAA -57
Get sequence
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