MirGeneDB ID | Hsa-Mir-506-P7b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-514a-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-506-P1 Hsa-Mir-506-P2 Hsa-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P4a1 Hsa-Mir-506-P4a2 Hsa-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P5 Hsa-Mir-506-P6a1 Hsa-Mir-506-P6a2 Hsa-Mir-506-P6b Hsa-Mir-506-P6c Hsa-Mir-506-P7a Hsa-Mir-506-P7c Hsa-Mir-506-P8 Hsa-Mir-506-P9 Hsa-Mir-506-P10 Hsa-Mir-506-P11 Hsa-Mir-506-P12 Hsa-Mir-506-P13 Hsa-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-506-P7 Cpo-Mir-506-o7b Mmu-Mir-506-P7 Rno-Mir-506-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 147284655-147284712 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P7b) |
Mir-506-P3
chrX: 147236945-147237002 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P8 chrX: 147250161-147250218 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4a2 chrX: 147258774-147258831 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4b chrX: 147259661-147259717 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4a1 chrX: 147260549-147260606 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5 chrX: 147272342-147272399 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7a chrX: 147279266-147279323 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7c chrX: 147281957-147282014 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7b chrX: 147284655-147284712 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAUCCUUAAACAUGUUGUCUGUGGUACCCUACUCUGGAGAGUGACAAUCAUGUAUAACUAAAUUUGAUUGACACUUCUGUGAGUAGAGUAACGCAUGACACUUACGACAGACAAUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCAUCCUUAAACAUGUU- - G C -| G A UGUAUA GUC UGUG UAC CUACUC UGGA AGUG CAAUCA A CAG ACGC AUG GAUGAG GUCU UCAC GUUAGU C GGUAACAGACAGCAUUCA U A A U^ - A UUAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-506-P7b_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0022702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCUGGAGAGUGACAAUCA -21
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-514a-5p TargetMiner: hsa-miR-514a-5p miRDB: MIMAT0022702 |
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Mature sequence | Hsa-Mir-506-P7b_3p |
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mirBase accession | MIMAT0002883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUUGACACUUCUGUGAGUAGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0002883 TargetScanVert: hsa-miR-514a-3p TargetMiner: hsa-miR-514a-3p miRDB: MIMAT0002883 |