MirGeneDB ID | Dno-Mir-506-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGGCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-506-P1 Dno-Mir-506-P3 Dno-Mir-506-P7f Dno-Mir-506-P7g Dno-Mir-506-P7h Dno-Mir-506-P7i | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P2f Bta-Mir-506-P2g Bta-Mir-506-P2h Cfa-Mir-506-P2d Cfa-Mir-506-P2e Cpo-Mir-506-o2 Cpo-Mir-506-P2a Cpo-Mir-506-P2b Cpo-Mir-506-P2c Hsa-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P2 Mmu-Mir-506-P2 Ocu-Mir-506-P2 Rno-Mir-506-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH564535: 655807-655864 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P2) |
Mir-506-P2
JH564535: 655807-655864 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P3 JH564535: 697744-697800 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUUUUCAUCUGUGCUGUGUGCAGUGCCCCCACUCCAGGAAGUGCCAUCCAUGUGGCUAAAAAUAUGAUUGGCAUUUCUUAGAGUGAAGUAAUGCACAACGUGUACAACAUAGGAGUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAUUUUCAUCUGUGCUG---| G CCC C UC UGUGGC UGUGCA UGC CACUC AGGAAGUGCCA CA U ACACGU AUG GUGAG UUCUUUACGGU GU A GUGAGGAUACAACAUGUGCA^ A AA- A UA AUAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-506-P2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CACUCCAGGAAGUGCCAUCCA -21
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-506-P2_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUUGGCAUUUCUUAGAGUGAA -58
Get sequence
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