| MirGeneDB ID | Dan-Mir-87-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-87 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dan-Mir-87-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-87 Dme-Mir-87-v2 Dmo-Mir-87-v2 Hme-Mir-87 Lgi-Mir-87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_12916: 13789788-13789859 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered MiRNAs (< 10kb from Mir-87-v2) |
Mir-87-v1
scaffold_12916: 13789788-13789859 [-]
Ensembl
Mir-87-v2 scaffold_12916: 13789788-13789859 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGUGAAUCCUUUCAAGCGGCAUAUUUCAUUCGCGCCUGUAUCUUGCUGAACCGUUACCGAUAUGGCACAGAAUCCGGUUGAGCAAAAUUUCAGGUGUGUGAGAAAUUUGUUAAGCAAUCUUCAAAAGAUAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGUGAAUCCUUUCAAGC-- U AUU U-| C G CGUUACCGAUAU GGCA AUUUC CGCGCCUG AU UUGCU AAC \ UUGU UAAAG GUGUGGAC UA AACGA UUG G GAUAGAAAACUUCUAACGAA U AGU UU^ A G GCCUAAGACACG 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-87-v2_5p* |
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| MirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGCGCCUGUAUCUUGCUGAAC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-87-v2_3p |
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| MirBase accession | MIMAT0008411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
49- UGAGCAAAAUUUCAGGUGUGUGA -72
Get sequence
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