MirGeneDB ID | Cte-Mir-210-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGUGCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cte-mir-210b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cte-Mir-210-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cgi-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dma-Mir-210 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Ebu-Mir-210 Efe-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mun-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pma-Mir-210 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Spt-Mir-210 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. teleta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_591: 25368-25430 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-P5) |
Mir-210-P6
CAPTEscaffold_591: 19538-19606 [-]
Ensembl
Mir-210-P5 CAPTEscaffold_591: 25368-25430 [-] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCAUGAGAGUGUCCUCGGCUGUCACUGCAGUUGCUGCUUCAUGCACAAGCAUUAUGUAAUCAUAACCUGCUGUGCGUAAAACAGCGACCUUUGUGGGAGGUAGAAAUCAUAGUAGCUCUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCAUGAGAGUGUCCUCGG--| G UGCA C C A UUAUGUA CU UCAC GUUGCUG UU AUGCACA GCA A GA GGUG CAGCGAC AA UGCGUGU CGU U ACUCUCGAUGAUACUAAAGAUG^ G UUUC A A - CCAAUAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cte-Mir-210-P5_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUUGCUGCUUCAUGCACAAGCA -23
Get sequence
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Mature sequence | Cte-Mir-210-P5_3p |
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mirBase accession | MIMAT0013572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CUGUGCGUAAAACAGCGACCUU -63
Get sequence
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