MirGeneDB ID | Sto-Mir-153-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cloudy Catshark (Scyliorhinus torazame) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Sto-Mir-153-P1 Sto-Mir-153-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-153-P2 Ami-Mir-153-P2 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Bta-Mir-153-P2 Cfa-Mir-153-P2 Cgi-Mir-153 Cin-Mir-153 Cli-Mir-153-P2 Cmi-Mir-153-P2 Cpi-Mir-153-P2 Cte-Mir-153 Dma-Mir-153 Dno-Mir-153-P2 Dpu-Mir-153 Dre-Mir-153-P2a Dre-Mir-153-P2b Gga-Mir-153-P2 Gja-Mir-153-P2 Gmo-Mir-153-P2a Hsa-Mir-153-P2 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lch-Mir-153-P2 Lgi-Mir-153 Loc-Mir-153-P2 Mal-Mir-153-P2a Mal-Mir-153-P2b Mdo-Mir-153-P2 Mml-Mir-153-P2 Mun-Mir-153-P2 Npo-Mir-153 Oan-Mir-153-P2 Obi-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pbv-Mir-153-P2 Pfl-Mir-153 Pma-Mir-153-o2 Pmi-Mir-153 Sha-Mir-153-P2 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Spt-Mir-153-P2 Spu-Mir-153 Tgu-Mir-153-P2 Tni-Mir-153-P2a Tni-Mir-153-P2b Xbo-Mir-153 Xla-Mir-153-P2c Xla-Mir-153-P2d Xtr-Mir-153-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003427355_STO_add) |
BFAA01010745.1: 49391-49451 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGCGACGCUCCUUUCUUAUGGCUCCCAGUGUCAUUUUUGUGAUUUGCAGCUAGUAAUCUCAAGGUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGCAGCUGUGCCUGCUGCAUGGUGCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGCGACGCUCCUUUCUU- C - -| AGUAAUC AUGGCU CCAGUG UCAUUUUUGUGAUU UGCAGCU U UGUCGA GGUUAC AGUGAAAACACUGA ACGUUGA C UACGUGGUACGUCGUCCG C U U^ CCUGGAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Sto-Mir-153-P2_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUUUGCAGCU -21
Get sequence
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Mature sequence | Sto-Mir-153-P2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UUGCAUAGUCACAAAAGUGAUC -61
Get sequence
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