| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-430-P7c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-430-P1 Mmu-Mir-430-P2 Mmu-Mir-430-P3 Mmu-Mir-430-P4 Mmu-Mir-430-P5a Mmu-Mir-430-P5b Mmu-Mir-430-P5c Mmu-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P7 Rno-Mir-430-P7c Xtr-Mir-430-o7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 3220655-3220712 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P7c) |
Mir-430-P5a
chr7: 3218639-3218697 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P7a chr7: 3218932-3218989 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5b chr7: 3219200-3219261 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7b chr7: 3219494-3219550 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5c chr7: 3220356-3220411 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7c chr7: 3220655-3220712 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr7: 3220779-3220837 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUGGAUCUAGCGAAAUUCCAUAUAGCCAUACUCAAAAUGGAGGCCCUAUCUAAGCUUUUAAGUGGAAAGUGCUUCCCUUUUGUGUGUUGCCAUGUGGAGAAAGCAUCGGAACUUCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUGGAUCUAGCGAAAU--| A C U U C A AAGCU UCCAUAU GC AUAC CAAAA GGAGGC CU UCU U AGGUGUA CG UGUG GUUUU CCUUCG GA AGG U AACUUCAAGGCUACGAAAG^ C U U C U A UGAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-430-P7c_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAAAAUGGAGGCCCUAUCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004574 TargetScanVert: mmu-miR-294-5p miRDB: MIMAT0004574 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-430-P7c_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAAGUGCUUCCCUUUUGUGUGU -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000372 TargetScanVert: mmu-miR-294-3p miRDB: MIMAT0000372 |
