MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3079 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGAUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-3079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr15: 76290892-76290954 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCCCAGACAACCUCUGCCAAGCUAAGGACUUUGAUCUGAUGAGCUAAGCUGGAGUUCCCAUUCACCUGGCUCCAGGCUCAUCAGAUGAAAGUCCUUAGCUUAGGUGUGGCCUUUGUUGGAGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCCCAGACAACCUCUG- -| G UAAG GUUCCCAU CC AAGCUAAGGACUUU AUCUGAUGAGC CUGGA \ GG UUCGAUUCCUGAAA UAGACUACUCG GACCU U UGAGGUUGUUUCCGGUGU A^ G ---- CGGUCCAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-3079_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUGAUCUGAUGAGCUAAGCUGGA -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3079-5p miRDB: MIMAT0014866 |
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Star sequence | Mmu-Mir-3079_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0014867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- CAGGCUCAUCAGAUGAAAGU -63
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3079-3p miRDB: MIMAT0014867 |