| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1955 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 92191994-92192056 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUGCUGUGAAAAGCUGGUUUACUUACUACAAGUCCCAGGAUGCACUGCAGCUUUUUCUUAACUUCAGAUAAGAGCAUUGCAUGCUGGGACAUGUAGUUGGUUUAAAUAGCACGGAGAACUCUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUGCUGUGAAAAGCUGGUUU--| U A G C AG UUUCUUA ACU ACUACA GUCCCAG AUGCA UGC CUU A UGG UGAUGU CAGGGUC UACGU ACG GAA C UUCUCAAGAGGCACGAUAAAUU^ U A G U A- UAGACUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1955_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUCCCAGGAUGCACUGCAGCUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009426 TargetScanVert: mmu-miR-1955-5p miRDB: MIMAT0009426 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1955_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- GAGCAUUGCAUGCUGGGACAUG -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1955-3p miRDB: MIMAT0017348 |
