MirGeneDB ID | Mmu-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-148 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmu-Mir-148-P1 Mmu-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-148-P3 Bta-Mir-148-P3 Cfa-Mir-148-P3 Cmi-Mir-148-P3 Cpi-Mir-148-P3 Cpo-Mir-148-P3 Dno-Mir-148-P3 Dre-Mir-148-P3 Ebu-Mir-148 Gmo-Mir-148-P3 Hsa-Mir-148-P3 Loc-Mir-148-P3 Mal-Mir-148-P3 Mdo-Mir-148-P3 Mml-Mir-148-P3 Oan-Mir-148-P3 Ocu-Mir-148-P3 Rno-Mir-148-P3 Sha-Mir-148-P3 Spt-Mir-148-P3 Sto-Mir-148-P3 Tni-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr11: 96850400-96850460 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGAGGCUCGUCGCCGCUGUUCCCCGGGCCUAGGUUCUGUGAUACACUCCGACUCGGGCUCUGGAGCAGUCAGUGCAUGACAGAACUUGGGCCCGGUAGGACCUUCUGCACCCAGCGGACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGGAGGCUCGUCGCCGCU- C-| G A CC CGGGCU GUUC CCGGGCCUAGGUUCUGU AU CACU GACU \ CAGG GGCCCGGGUUCAAGACA UA GUGA CUGA C UCAGGCGACCCACGUCUUC AU^ G C -- CGAGGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There is a second Drosha cut +1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-148-P3_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0016991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGGUUCUGUGAUACACUCCGACU -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-152-5p miRDB: MIMAT0016991 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-148-P3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG -61
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000162 TargetScanVert: mmu-miR-152-3p miRDB: MIMAT0000162 |