| MirGeneDB ID | Mml-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-459 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-459 Bta-Mir-459 Cfa-Mir-459 Cli-Mir-459 Cpi-Mir-459 Cpo-Mir-459 Dno-Mir-459 Dre-Mir-459 Ebu-Mir-459 Ete-Mir-459 Gmo-Mir-459 Hsa-Mir-459 Loc-Mir-459 Mal-Mir-459 Mmu-Mir-459 Mun-Mir-459 Oan-Mir-459 Ocu-Mir-459 Pma-Mir-459 Rno-Mir-459 Spt-Mir-459 Sto-Mir-459 Tni-Mir-459 Xla-Mir-459-P1 Xla-Mir-459-P2 Xtr-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr3: 10995721-10995781 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUUGGCCACCACUCGUUCUGUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAUCAUGCAGCAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGGACCUCACAAGGGAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUUGGCCACCACUCGUU--| U AUC A A GUCCA CUGUUA UUGCA AGU ACAAAGAUUC UCCUUGU U GAUAAU AAUGU UCA UGUUUCUAAG AGGAACG C GAAGGGAACACUCCAGGUC^ U GAU C - ACGUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-459_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-802 |
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| Star sequence | Mml-Mir-459_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGU -61
Get sequence
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