MirGeneDB 2.1

MirGeneDB ID

Mml-Mir-430-P5

Family name MIR-430 (all species)
Seed GUGCCGC
Species Rhesus monkey (Macaca mulatta)
MiRBase ID mml-mir-371
Paralogues Mml-Mir-430-P1  Mml-Mir-430-P2  Mml-Mir-430-P3  Mml-Mir-430-P4  Mml-Mir-430-P6  Mml-Mir-430-P7  Mml-Mir-430-P8  Mml-Mir-430-P9c  Mml-Mir-430-P9d  Mml-Mir-430-P9e  Mml-Mir-430-P10  Mml-Mir-430-P11a  Mml-Mir-430-P11b  Mml-Mir-430-P12  Mml-Mir-430-P13a1  Mml-Mir-430-P13a2  Mml-Mir-430-P13b  Mml-Mir-430-P13c  Mml-Mir-430-P14  Mml-Mir-430-P18  Mml-Mir-430-P19  Mml-Mir-430-P21  Mml-Mir-430-P24a1  Mml-Mir-430-P24a2  Mml-Mir-430-P24b  Mml-Mir-430-P26a  Mml-Mir-430-P26b  Mml-Mir-430-P27  Mml-Mir-430-P28  Mml-Mir-430-P29c  Mml-Mir-430-P29d  Mml-Mir-430-P31c  Mml-Mir-430-P31d  Mml-Mir-430-P33  Mml-Mir-430-P35d  Mml-Mir-430-P35e  Mml-Mir-430-P35f-v1  Mml-Mir-430-P35f-v2  Mml-Mir-430-P37  Mml-Mir-430-P41  Mml-Mir-430-P42  Mml-Mir-430-P43  Mml-Mir-430-P44  Mml-Mir-430-P45  Mml-Mir-430-P47  Mml-Mir-430-P49 
Orthologues Bta-Mir-430-P5  Cfa-Mir-430-P5d1  Cfa-Mir-430-P5d2  Cpo-Mir-430-P5  Dno-Mir-430-P5  Ete-Mir-430-P5  Hsa-Mir-430-P5  Mmu-Mir-430-P5a  Mmu-Mir-430-P5b  Mmu-Mir-430-P5c  Ocu-Mir-430-P5  Rno-Mir-430-P5a  Rno-Mir-430-P5b  Rno-Mir-430-P5c  Xla-Mir-430-o5o1  Xla-Mir-430-o5o2  Xla-Mir-430-o5p1  Xla-Mir-430-o5p2  Xla-Mir-430-o5q1  Xla-Mir-430-o5q2  Xla-Mir-430-o5r  Xla-Mir-430-o5s  Xtr-Mir-430-o5a1  Xtr-Mir-430-o5a2  Xtr-Mir-430-o5a3  Xtr-Mir-430-o5a4  Xtr-Mir-430-o5a5  Xtr-Mir-430-o5a6  Xtr-Mir-430-o5a7  Xtr-Mir-430-o5a8  Xtr-Mir-430-o5a9  Xtr-Mir-430-o5a10  Xtr-Mir-430-o5a11  Xtr-Mir-430-o5a12  Xtr-Mir-430-o5a13  Xtr-Mir-430-o5a14  Xtr-Mir-430-o5a15  Xtr-Mir-430-o5a16  Xtr-Mir-430-o5a17  Xtr-Mir-430-o5a18  Xtr-Mir-430-o5a19  Xtr-Mir-430-o5a20  Xtr-Mir-430-o5a21  Xtr-Mir-430-o5a22  Xtr-Mir-430-o5a23  Xtr-Mir-430-o5b  Xtr-Mir-430-o5c1  Xtr-Mir-430-o5c2  Xtr-Mir-430-o5c3  Xtr-Mir-430-o5c4  Xtr-Mir-430-o5c5  Xtr-Mir-430-o5c6  Xtr-Mir-430-o5c7  Xtr-Mir-430-o5c8  Xtr-Mir-430-o5c9  Xtr-Mir-430-o5c10  Xtr-Mir-430-o5c11  Xtr-Mir-430-o5c12  Xtr-Mir-430-o5c13  Xtr-Mir-430-o5c14  Xtr-Mir-430-o5c15  Xtr-Mir-430-o5c16  Xtr-Mir-430-o5c17  Xtr-Mir-430-o5c18  Xtr-Mir-430-o5c19  Xtr-Mir-430-o5c20  Xtr-Mir-430-o5c21  Xtr-Mir-430-o5c22  Xtr-Mir-430-o5c23  Xtr-Mir-430-o5c24  Xtr-Mir-430-o5c25  Xtr-Mir-430-o5d1  Xtr-Mir-430-o5d2  Xtr-Mir-430-o5e  Xtr-Mir-430-o5f1  Xtr-Mir-430-o5f2  Xtr-Mir-430-o5g  Xtr-Mir-430-o5h  Xtr-Mir-430-o5j  Xtr-Mir-430-o5k1  Xtr-Mir-430-o5k2  Xtr-Mir-430-o5k3  Xtr-Mir-430-o5k4  Xtr-Mir-430-o5k5  Xtr-Mir-430-o5k6  Xtr-Mir-430-o5k7  Xtr-Mir-430-o5k8  Xtr-Mir-430-o5k9  Xtr-Mir-430-o5k10  Xtr-Mir-430-o5k11  Xtr-Mir-430-o5k12  Xtr-Mir-430-o5k13  Xtr-Mir-430-o5k14  Xtr-Mir-430-o5k15  Xtr-Mir-430-o5k16  Xtr-Mir-430-o5k17  Xtr-Mir-430-o5k18  Xtr-Mir-430-o5k19  Xtr-Mir-430-o5k20  Xtr-Mir-430-o5k21  Xtr-Mir-430-o5k22  Xtr-Mir-430-o5k23  Xtr-Mir-430-o5k24  Xtr-Mir-430-o5k25  Xtr-Mir-430-o5k26  Xtr-Mir-430-o5k27  Xtr-Mir-430-o5l1  Xtr-Mir-430-o5l2  Xtr-Mir-430-o5l3  Xtr-Mir-430-o5l4  Xtr-Mir-430-o5l5  Xtr-Mir-430-o5l6  Xtr-Mir-430-o5l7  Xtr-Mir-430-o5l8  Xtr-Mir-430-o5l9  Xtr-Mir-430-o5l10  Xtr-Mir-430-o5l11  Xtr-Mir-430-o5l12  Xtr-Mir-430-o5l13  Xtr-Mir-430-o5l14  Xtr-Mir-430-o5l15  Xtr-Mir-430-o5l16  Xtr-Mir-430-o5l17  Xtr-Mir-430-o5l18  Xtr-Mir-430-o5l19  Xtr-Mir-430-o5m  Xtr-Mir-430-o5n1  Xtr-Mir-430-o5n2 
Node of Origin (locus) Eutheria
Node of Origin (family) Vertebrata
Genome context
(rheMac8_trace)
chr19: 49142073-49142134 [+] UCSC Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-P5)
Mir-430-P24a1 chr19: 49092996-49093055 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P35e chr19: 49094969-49095027 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P37 chr19: 49102341-49102401 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P29c chr19: 49104035-49104095 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P41 chr19: 49105608-49105667 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P24b chr19: 49108097-49108156 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P31d chr19: 49109643-49109704 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P31c chr19: 49114300-49114361 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P5 chr19: 49142073-49142134 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P6 chr19: 49142282-49142340 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P7 chr19: 49142989-49143049 [+] UCSC Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCGCCUUGCCGCAUCCCCUCAGCCUGUGGCACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGCUCUCUGGUGAAAAAAGUGCCGCCAUGUUUUGAGUGUUACCGAUUGAGAAAACCCGCCAUUUUGGUA
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50        60
CCGCCUUGCCGCAUCCC--|    CCU            CU    G        CUGCUCU 
                   CUCAG   GUGGCACUCAAA  GUGG GGCACUUU       C
                   GAGUU   CAUUGUGAGUUU  UACC CCGUGAAA       U
AUGGUUUUACCGCCCAAAA^    AGC            UG    G        AAAGUGG 
120       110       100        90        80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
 +
Bo Br Br Br He Ki Li Lu Ly Sk Sp Te Th
Star sequence

Mml-Mir-430-P5_5p*

mirBase accessionMIMAT0006296
Sequence
0- ACUCAAACUGUGGGGGCACUUU -22
Get sequence
Proposed targets TargetScanVert: mml-miR-371-5p
Mature sequence

Mml-Mir-430-P5_3p

mirBase accessionMIMAT0006297
Sequence
40- AGUGCCGCCAUGUUUUGAGUGU -62
Get sequence
Proposed targets TargetScanVert: mml-miR-371-3p