MirGeneDB ID | Mml-Mir-34-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-34 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-34b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-34-P1 Mml-Mir-34-P2b Mml-Mir-34-P3b Mml-Mir-34-P3c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-34 Aca-Mir-34-P2a Ami-Mir-34-P2a Asu-Mir-34 Bge-Mir-34 Bta-Mir-34-P2a Cbr-Mir-34 Cel-Mir-34 Cfa-Mir-34-P2a Cgi-Mir-34 Cin-Mir-34 Cli-Mir-34-P2a Cmi-Mir-34-P2a Cpi-Mir-34-P2a Cpo-Mir-34-P2a Cte-Mir-34 Dan-Mir-34 Dma-Mir-34 Dme-Mir-34 Dmo-Mir-34 Dno-Mir-34-P2a Dpu-Mir-34 Dre-Mir-34-P2a Dsi-Mir-34 Dya-Mir-34 Ebu-Mir-34-P2a Efe-Mir-34 Esc-Mir-34 Ete-Mir-34-P2a Gga-Mir-34-P2a Gja-Mir-34-P2a Hsa-Mir-34-P2a Isc-Mir-34 Lch-Mir-34-P2a Lgi-Mir-34 Loc-Mir-34-P2a Mdo-Mir-34-P2a Mmu-Mir-34-P2a Mun-Mir-34-P2a Npo-Mir-34 Oan-Mir-34-P2a Obi-Mir-34 Ocu-Mir-34-P2a Ovu-Mir-34 Pbv-Mir-34-P2a Pfl-Mir-34 Pmi-Mir-34 Rno-Mir-34-P2a Sha-Mir-34-P2a Sko-Mir-34 Spt-Mir-34-P2a Spu-Mir-34 Sto-Mir-34-P2a Tca-Mir-34 Tgu-Mir-34-P2a Xbo-Mir-34 Xla-Mir-34-P2a1a Xla-Mir-34-P2a1b Xla-Mir-34-P2a2a Xla-Mir-34-P2a2b Xtr-Mir-34-P2a1 Xtr-Mir-34-P2a2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr14: 104382415-104382473 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-34-P2a) |
Mir-34-P2a
chr14: 104382415-104382473 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-34-P2b chr14: 104382917-104382971 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGCCGCGGACGCCCAGUGCUCGGUUUGUAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUGUACUGUGGUGGUUACAAUCACUAACUCCACUGCCAUCAAAACAAGGCACAGCAUCAUCCGCCGCCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCAGCCGCGGACGCCCA- CG GUA-| UCA C ACUGU GUGCU GUUU GGCAGUG UUAG UGAUUGU G CACGG CAAA CCGUCAC AAUC ACUAACA G GCCCGCCGCCUACUACGA AA ACUA^ CUC - UUGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mml-Mir-34-P2a_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUGU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mml-Mir-34-P2a_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0006174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAUCACUAACUCCACUGCCAUC -59
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-34b |