MirGeneDB ID | Mml-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-192 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGACCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-192-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-192-P2 Bta-Mir-192-P2 Cfa-Mir-192-P2 Cpi-Mir-192-P2 Cpo-Mir-192-P2 Dno-Mir-192-P2 Dre-Mir-192-P2b Ete-Mir-192-P2 Gja-Mir-192-P2 Gmo-Mir-192-P2b Hsa-Mir-192-P2 Loc-Mir-192-P2 Mal-Mir-192-P2b Mmu-Mir-192-P2 Mun-Mir-192-P2 Oan-Mir-192-P2 Ocu-Mir-192-P2 Rno-Mir-192-P2 Sha-Mir-192-P2 Spt-Mir-192-P2 Tni-Mir-192-P2b-v1 Tni-Mir-192-P2b-v2 Xla-Mir-192-P2c Xla-Mir-192-P2d Xtr-Mir-192-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr14: 9567228-9567292 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-192-P2) |
Mir-194-P2
chr14: 9567026-9567083 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-192-P2 chr14: 9567228-9567292 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUGGGCUGCUGAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCUAUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGCCACCAGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGGGCUGCUGAGACCGA-- C GG C- -| A AGUGCUCUC GUG ACA GCU UGACCUAU GAAUUG CAGCC G CGC UGU UGG ACUGGAUA CUUAAC GUCGG U AGGACCACCGACCGUAACUC U A- AC C^ C UCUCCCCUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-192-P2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGACCUAUGAAUUGACAGCC -21
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-192-5p |
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Star sequence | Mml-Mir-192-P2_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0026835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- CUGCCAAUUCCAUAGGUCACAG -65
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-192-3p |