| MirGeneDB ID | Lgi-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Owl limpet (Lottia gigantea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | lgi-mir-981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-76 Asu-Mir-76 Bge-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Cgi-Mir-76 Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Hme-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Lotgi1) |
LOTGIsca_42: 846613-846673 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUGUUAAGAAGAGAUAUUCAGACAUUUUGACGGGUUUCGCGAUUUGCGAACAGUCUAACGGAUUGUGUUCGUUGUCGACGAAACCUGCCUUAAGCCCCUGAUCAUCCUGCAAUGGUACAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUGUUAAGAAGAGAUAU- ACAU -- -| UU GUCUAA UCAG UUUGA CGGGUUUCG CGAU GCGAACA \ AGUC GAAUU GUCCAAAGC GCUG UGCUUGU C AACAUGGUAACGUCCUACU CCC- CC A^ U- GUUAGG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lgi-Mir-76_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUUUCGCGAUUUGCGAACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lgi-Mir-76_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUCGUUGUCGACGAAACCUGCCU -61
Get sequence
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