| MirGeneDB ID | Lgi-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-315 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Owl limpet (Lottia gigantea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | lgi-mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-315 Bge-Mir-315 Bpl-Mir-315 Cbr-Mir-315 Cel-Mir-315 Cgi-Mir-315-v1 Cgi-Mir-315-v2 Csc-Mir-315 Cte-Mir-315 Dan-Mir-315 Dma-Mir-315 Dme-Mir-315 Dmo-Mir-315 Dpu-Mir-315 Dsi-Mir-315 Dya-Mir-315 Efe-Mir-315 Esc-Mir-315 Isc-Mir-315 Lan-Mir-315 Lpo-Mir-315-P3 Lpo-Mir-315-P4 Lpo-Mir-315-P5 Lpo-Mir-315-P6-v1 Lpo-Mir-315-P6-v2 Npo-Mir-315 Obi-Mir-315 Ovu-Mir-315 Pfl-Mir-315 Pma-Mir-315 Sko-Mir-315 Sme-Mir-315 Tca-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Lotgi1) |
LOTGIsca_791: 650-711 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGAAUAUAAAUUAACAUUAUCUUCUCAAAUUUUGAUUGUUGCUCAGAAAGCCGUAAUGUUUAACUCCGGCGCUCGGGCAACAAUCAACUAAUGAUGGAGGUAUGAAGUCAACAACCAAAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUGAAUAUAAAUUAACAU- -| AAUU A AA GUAAUGU UAUCUUC UCA UUGAUUGUUGCUC GA GCC \ AUGGAGG AGU AACUAACAACGGG CU CGG U UUAAACCAACAACUGAAGU U^ AAUC - CG CCUCAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lgi-Mir-315_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGAUUGUUGCUCAGAAAGCC -23
Get sequence
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| Star sequence | Lgi-Mir-315_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CGCUCGGGCAACAAUCAACUAA -62
Get sequence
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