MirGeneDB ID | Lan-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aae-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cgi-Mir-67-P4 Cgi-Mir-67-P5 Cgi-Mir-67-P6 Csc-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dan-Mir-67-v2 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dme-Mir-67-v2 Dme-Mir-67-v3 Dmo-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dsi-Mir-67-v2 Dsi-Mir-67-v3 Dya-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v3 Efe-Mir-67-P1 Efe-Mir-67-P2 Efe-Mir-67-P3 Hme-Mir-67-v1 Hme-Mir-67-v2 Isc-Mir-67 Lgi-Mir-67 Lpo-Mir-67-P7 Lpo-Mir-67-P8 Lpo-Mir-67-P9 Lpo-Mir-67-P10 Lpo-Mir-67-P11 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ovu-Mir-67 Sme-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tca-Mir-67-v2 Tca-Mir-67-v3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01001053: 100933-100993 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGUUUCCACGAGAUGUUUCUGCCACGUUUACCUCAAUCAGUGGGUUGUGAUGUAAUAGUGACGUCAUCACAACCUGCAUGAAGGAGGUAAAUUUGGCGGUUCUAUCAACAAAGUUUCCCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GAGUUUCCACGAGAUGUUU-- C AA -|UG UAAUA CUGCCA GUUUACCUC UCA G GGUUGUGAUG G GGCGGU UAAAUGGAG AGU C CCAACACUAC U ACCCUUUGAAACAACUAUCUU U GA A^GU UGCAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Lan-Mir-67_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCUCAAUCAGUGGGUUGUGAUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Lan-Mir-67_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UCACAACCUGCAUGAAGGAGGUAA -61
Get sequence
|