| MirGeneDB ID | Lan-Mir-242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-242 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bfl-Mir-242 Bla-Mir-242-v1 Bla-Mir-242-v2 Bpl-Mir-242 Cbr-Mir-242 Cel-Mir-242 Cgi-Mir-242 Cte-Mir-242 Lgi-Mir-242-P1 Lgi-Mir-242-P2 Npo-Mir-242 Pfl-Mir-242 Pmi-Mir-242 Sko-Mir-242 Spu-Mir-242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01001408: 48107-48163 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAACAGCGGCGGGUAAGGGAGGGCCAGAUGUUGCGUAGGCGUUGUGCAUAGCUUUCAGACGACGUUAUGCAUCUCAUCUGCGCAUCCUCGGUGUUCCCCGGGACUUCCACGAAGGCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAACAGCGGCGGGUAAG---| G A UGU CGUU UUUCA GGAG GCC GA UGCGUAGG GUGCAUAGC \ CCUU UGG CU ACGCGUCU UACGUAUUG G UCGGAAGCACCUUCAGGGCC^ G - CCU ACUC CAGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lan-Mir-242_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGCGUAGGCGUUGUGCAUAGC -22
Get sequence
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| Star sequence | Lan-Mir-242_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UAUGCAUCUCAUCUGCGCAUCC -57
Get sequence
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