MirGeneDB ID | Hsa-Mir-26-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-26a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-26-P2 Hsa-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-26-P1 Ami-Mir-26-P1 Bta-Mir-26-P1 Cfa-Mir-26-P1 Cli-Mir-26-P1 Cmi-Mir-26-P1 Cpi-Mir-26-P1 Cpo-Mir-26-P1 Dno-Mir-26-P1 Dre-Mir-26-P1a Dre-Mir-26-P1b Ete-Mir-26-P1 Gga-Mir-26-P1 Gja-Mir-26-P1 Gmo-Mir-26-P1a Gmo-Mir-26-P1b Lch-Mir-26-P1 Loc-Mir-26-P1 Mal-Mir-26-P1a Mal-Mir-26-P1b Mdo-Mir-26-P1 Mml-Mir-26-P1 Mmu-Mir-26-P1 Mun-Mir-26-P1 Oan-Mir-26-P1 Ocu-Mir-26-P1 Pbv-Mir-26-P1 Pma-Mir-26-o1 Rno-Mir-26-P1 Sha-Mir-26-P1 Spt-Mir-26-P1 Sto-Mir-26-P1 Tgu-Mir-26-P1 Tni-Mir-26-P1a Tni-Mir-26-P1b Xla-Mir-26-P1c Xla-Mir-26-P1d Xtr-Mir-26-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr3: 37969413-37969473 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCAAGGCCCUGGCGAAGGCCGUGGCCUCGUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUGCAGGUCCCAAUGGGCCUAUUCUUGGUUACUUGCACGGGGACGCGGGCCUGGACGCCGGCAUCCGGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCAAGGCCCUGGCGAA- -| G U C GUGCAGG GG CCGUG CCUCGU CAAGUAAUC AGGAUAGGCU \ CC GGCGC GGGGCA GUUCAUUGG UCUUAUCCGG U GGGCCUACGGCCGCAGGU G^ A C U GUAACCC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-26-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000082 TargetScanVert: hsa-miR-26a-5p TargetMiner: hsa-miR-26a-5p miRDB: MIMAT0000082 |
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Star sequence | Hsa-Mir-26-P1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CCUAUUCUUGGUUACUUGCACG -61
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004499 TargetScanVert: hsa-miR-26a-1-3p TargetMiner: hsa-miR-26a-1-3p miRDB: MIMAT0004499 |