MirGeneDB ID | Dme-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-315 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUGAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-315 Bge-Mir-315 Bpl-Mir-315 Cbr-Mir-315 Cel-Mir-315 Cgi-Mir-315-v1 Cgi-Mir-315-v2 Csc-Mir-315 Cte-Mir-315 Dan-Mir-315 Dma-Mir-315 Dmo-Mir-315 Dpu-Mir-315 Dsi-Mir-315 Dya-Mir-315 Efe-Mir-315 Esc-Mir-315 Isc-Mir-315 Lan-Mir-315 Lgi-Mir-315 Lpo-Mir-315-P3 Lpo-Mir-315-P4 Lpo-Mir-315-P5 Lpo-Mir-315-P6-v1 Lpo-Mir-315-P6-v2 Npo-Mir-315 Obi-Mir-315 Ovu-Mir-315 Pfl-Mir-315 Pma-Mir-315 Sko-Mir-315 Sme-Mir-315 Tca-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3L: 18860982-18861045 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAAGAGUUCCUUCACGGACACUUAUAUAAUUUUGAUUGUUGCUCAGAAAGCCCUCAUUGUUUACCAGUUGGCUUUCGAGCAAUAAUUGAAACCAGAUAAGUGAUCCCCUCAACGCUGACGAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAAGAGUUCCUUCACGGA--| AUAA UG A CUCAUUGU CACUUAU UUU AUUGUUGCUC GAAAGCC \ GUGAAUA AAA UAAUAACGAG CUUUCGG U UUAGCAGUCGCAACUCCCCUA^ GACC GU - UUGACCAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-315_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUUGAUUGUUGCUCAGAAAGCC -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000407 TargetScanFly: dme-miR-315 |
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Star sequence | Dme-Mir-315_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0020841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- CUUUCGAGCAAUAAUUGAAACC -64
Get sequence
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