| MirGeneDB ID | Cte-Bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | BANTAM (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cte-bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Bantam Asu-Bantam-o1 Asu-Bantam-o2 Asu-Bantam-o3 Bge-Bantam Bpl-Bantam Cbr-Bantam-P1a Cbr-Bantam-P1b Cbr-Bantam-P2 Cbr-Bantam-P3 Cbr-Bantam-P4 Cel-Bantam-P1 Cel-Bantam-P2 Cel-Bantam-P3 Cel-Bantam-P4 Cel-Bantam-P5a Cel-Bantam-P5b Cel-Bantam-P5c Cgi-Bantam Csc-Bantam-P16 Csc-Bantam-P17 Dan-Bantam Dma-Bantam Dme-Bantam Dmo-Bantam Dpu-Bantam Dsi-Bantam Dya-Bantam Efe-Bantam-P6 Efe-Bantam-P7 Efe-Bantam-P8 Esc-Bantam Hme-Bantam Isc-Bantam-P9a Isc-Bantam-P9b Lan-Bantam Lgi-Bantam Lpo-Bantam-P10 Lpo-Bantam-P11 Lpo-Bantam-P12 Lpo-Bantam-P13 Lpo-Bantam-P14 Lpo-Bantam-P15 Npo-Bantam Ovu-Bantam Sme-Bantam-P18 Sme-Bantam-P19 Sme-Bantam-P20 Tca-Bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_114: 319163-319225 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCGAAUGUUUCAGAGCAAGACUUGCGAGACUGGUUUUCUCUUUGGUCUUCCAGAUUUUUAUUGGAAUUCUGAGAUCAUUGUGAAAACUAAUCUCGCUGACAUUACGCCAGAUCUUUAAUUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCGAAUGUUUCAGAGCAAGACUU--| C UCUU UC UUUUUA GCGAGA UGGUUUUC UGGUCU CAGA \ CGCUCU AUCAAAAG ACUAGA GUCU U ACUUAAUUUCUAGACCGCAUUACAGU^ A UGUU -- UAAGGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cte-Bantam_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUGGUUUUCUCUUUGGUCUUCCAGA -25
Get sequence
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| Mature sequence | Cte-Bantam_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGAGAUCAUUGUGAAAACUAAUC -63
Get sequence
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