MirGeneDB ID | Cfa-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-186 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-186 Cpo-Mir-186 Dno-Mir-186 Ete-Mir-186 Hsa-Mir-186 Mdo-Mir-186 Mml-Mir-186 Mmu-Mir-186 Oan-Mir-186 Ocu-Mir-186 Rno-Mir-186 Sha-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chr6: 74881615-74881675 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAACAUUUUUUUCAUUGCUUAUAACUUUCCAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUUUCUGAUUUUAUUUUAAGCCCAAAGGUGAAUUUUUUGGGAAGUUUGAGCUAAAUUCCUUCAACCAAAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAACAUUUUUUUCAUU---| U U U UCUGAU GCUUA AACUUUCCAAAGAAUUC CCUUU GGGCUU U CGAGU UUGAAGGGUUUUUUAAG GGAAA CCCGAA U UAAAACCAACUUCCUUAAAU^ - U - UUUUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cfa-Mir-186_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-186 miRDB: MIMAT0006694 |
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Star sequence | Cfa-Mir-186_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- GCCCAAAGGUGAAUUUUUUGGG -61
Get sequence
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