MirGeneDB ID | Cel-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-76 Asu-Mir-76 Bge-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cgi-Mir-76 Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Hme-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lgi-Mir-76 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrIII: 3142060-3142126 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCAGGUAAGAUAAAAUUUCAGCUCCUGUCUGGGCUUCACAAUAGUCGAAUACCUUAAAUUUCAAAAUUUGGAUAUUCGUUGUUGAUGAAGCCUUGAUGGGGGUGAGAAAGAAGUUUGCUUAGCUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCAGGUAAGAUAAAAU- A- U -| U CCUUAAAUUU UUC GCUCCUGUC GGGCUUCA CAAUAG CGAAUA \ AAG UGGGGGUAG UCCGAAGU GUUGUU GCUUAU C ACUCGAUUCGUUUGAAGA AG U A^ - AGGUUUAAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Cel-Mir-76_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0020321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGGCUUCACAAUAGUCGAAUA -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Cel-Mir-76_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0000048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
45- UUCGUUGUUGAUGAAGCCUUGA -67
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000048 TargetScanWorm: cel-miR-76 |